[发明专利]一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法在审
申请号: | 202111487621.3 | 申请日: | 2021-12-08 |
公开(公告)号: | CN114354778A | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 杨霜;李佳佳 | 申请(专利权)人: | 苏州大学 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/06;G01N30/12;G01N30/86 |
代理公司: | 苏州翔远专利代理事务所(普通合伙) 32251 | 代理人: | 陆金星 |
地址: | 215137 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 富集 结合 糖肽 切分 tn 抗原 方法 | ||
1.一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法,其特征在于,包括步骤:
1)蛋白提取和浓度测量;
2)蛋白酶解;
3)多肽纯化;
4)固相结合;
5)唾液酸处理;
6)N聚糖切除;
7)OpeRATOR酶切;
8)O-Glycoprotease酶切;
9)LC-MS分析。
2.根据权利要求1所述的一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法,其特征在于,在步骤1)中,所述蛋白提取和浓度测量包括:在细胞中依次加入RIPA裂解液、蛋白酶抑制剂和EDTA后,使用超声破碎仪破碎,冷却,重复操作直至样本溶液澄清,离心,取上层清液并用1×Tris稀释,使用Pierce BCA蛋白定量分析试剂盒测试蛋白的浓度。
3.根据权利要求2所述的一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法,其特征在于,在步骤2)中,所述蛋白酶解包括步骤:
(1)根据测定的蛋白的浓度,从上层清液中取蛋白,使得所述蛋白的总量在400-600ug,溶于尿素,轻微振荡,直至蛋白完全溶解,获得样品溶液;
(2)向所述样品溶液中加入总体积1/10的TCEP,孵育;
(3)向所述样品溶液中加入总体积1/10的IAA,置于暗箱中孵育;
(4)向所述样品溶液中加入HPLC水,使得所述样品溶液中尿素的浓度<1.6M,调节所述样品溶液的pH至7-9;
(5)向所述样品溶液中加入胰蛋白酶,使得所述样品溶液的蛋白量与所述胰蛋白酶的体积比为50:1~40:1,孵育过夜。
4.根据权利要求3所述的一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法,其特征在于,在步骤3)中,所述多肽纯化包括步骤:
(1)向所述样品溶液中加入甲酸,使所述样品溶液的pH<3;
(2)将所述样品溶液加入预先处理的C18萃取柱中,重复操作;
(3)使用0.1%TFA多次清洗萃取柱;
(4)使用50%ACN+0.1%TFA洗脱C18萃取柱中的多肽并收集洗脱液,重复操作;
(5)将多次多肽的洗脱液合并真空冷冻干燥获得多肽样品。
5.根据权利要求4所述的一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法,其特征在于,在步骤4)中,所述固相结合包括步骤:
(1)配置缓冲液体系,测试pH 10-11,将所述缓冲液体系稀释;
(2)取表面具有醛基的球状树脂的固相,加入所述缓冲液体系预处理,去掉过滤液,重复操作两次;
(3)将所述多肽样品重新溶于去离子水中,涡旋振荡,并加入具有缓冲液体系的固相中,涡旋,并孵育、离心去除溶液,获得固相样品;
(4)向所述固相样品中加入NaCNBH3,涡旋,孵育后离心去除溶液;
(5)使用PBS涡旋离心去除溶液,清洗;
(6)向所述固相样品中加入PBS和NaCNBH3,孵育,涡旋离心去除溶液;
(7)使用Tris-HCl清洗所述固相样品,再加入NaCNBH3和1×Tris,孵育,分别使用NaCl和去离子水清洗所述固相样品。
6.根据权利要求5所述的一种基于固相富集结合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法,其特征在于,在步骤5)中,所述唾液酸处理包括:向所述固相样品中加入1×PBS,并用1%TFA调节pH为5.5,再加入神经氨酸苷酶,孵育,涡旋,离心去除溶液,并用10%ACN+0.1%TFA洗脱所述固相样品。
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