[发明专利]一种与黄瓜成株期耐热相关的SNP标记、引物组、试剂盒及应用

说明书

本发明提供了一种与黄瓜成株期耐热相关的SNP标记、引物组、试剂盒及应用，属于分子生物学辅助育种技术领域。与黄瓜成株期耐热相关的SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述SEQ ID NO:1的第190位存在T/C多态性；当所述SNP标记的190位碱基为T时，黄瓜材料的成株期耐热性好；当所述SNP标记的190位碱基为C时，黄瓜材料的成株期耐热性差。本发明不仅为黄瓜成株期耐热性的精细定位和分子克隆奠定了基础，同时也为利用分子标记辅助选育耐热的黄瓜新品种提供了高效的途径。

技术领域

本发明属于分子生物学辅助育种技术领域，具体涉及一种与黄瓜成株期耐热相关的SNP标记、引物组、试剂盒及应用。

背景技术

黄瓜(Cucumissativus L.)是世界上最重要的蔬菜作物之一。黄瓜原产于热带地区，但对高温敏感。黄瓜生长的最适温度是白天25～28℃，夜间15～20℃。随着全球气温升高，黄瓜在生产中更容易受到热胁迫。夏季露天栽培温度往往超过35℃，容易造成黄瓜叶片晒伤，茎、根生长迟缓，果实畸形甚至植株死亡，严重影响了黄瓜产量和果实品质。研究黄瓜成株期耐热性的遗传规律及分子标记，对于选育符合市场需求的新品种具有重要意义。

目前，关于黄瓜成株期耐热性的遗传规律还未见报道，黄瓜耐热性研究多集中在苗期。杨寅桂利用耐热自交系“Poinsett 97”和不耐热自交系“Boothbyls Blonde”鉴定出了1个与黄瓜幼苗期耐热相关的SSR标记，该成果在2007年被记录在南京农业大学硕士论文《黄瓜耐热性及热胁迫响应基因研究》中。杨迪菲以相对电导率为指标，鉴定出与黄瓜苗期耐热性相关的4个SSR和7个RAPD标记，该成果在2006年被记录在东北农业大学硕士论文中。庄影在5号染色体上鉴定出1个与黄瓜苗期耐热性相关的QTL，表型变异率为11％，该成果在2014年被记录在扬州大学硕士论文《黄瓜耐热性遗传及QTL初步定位》。研究表明，‘L-9’(耐热)黄瓜幼苗的耐热性是由第1染色体上的一个单基因控制的，该基因两侧分别是Indel-H90和Indel-H224，在王敏等人于2019年在《HortScience》第54期第423-428页上发表的文章《Genetic analysis and related gene primary mapping of heat stress tolerancein cucumber using bulked segregant analysis》中也有记载。董邵云等(2020)鉴定出6个与黄瓜苗期耐热性相关的QTL，包括qHT3.1、qHT3.2、qHT3.3、qHT4.1、qHT4.2和qHT6.1，其中qHT3.2表型解释率为28.3％，该成果被记载在《Plants》杂志第9期第9卷1155页《Identification of Quantitative Trait Loci Controlling High-TemperatureTolerance in Cucumber(Cucumis sativus L.)Seedlings》中。然而，在这些苗期耐热研究中，还没有开发出与耐热基因紧密连锁的分子标记，也没有克隆到相关基因。此外，也尚未有与黄瓜成株期耐热性相关的研究报道。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种与黄瓜成株期耐热相关的SNP标记、引物组、试剂盒及应用，本发明的SNP标记与黄瓜成株期耐热基因Csht紧密连锁。

本发明提供了一种与黄瓜成株期耐热相关的SNP标记，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述SEQ ID NO:1的第190位存在T/C多态性。

本发明还提供了一种用于检测上述方案所述SNP标记的引物组，正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示，反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。

本发明还提供了一种用于检测上述方案所述SNP标记的试剂盒，包括上述方案所述的引物组和PCR扩增用试剂。

本发明还提供了上述方案所述的SNP标记或者所述的引物组或者上述方案所述的试剂盒在耐热黄瓜品种选育中的应用。