[发明专利]一种鉴定硝化微生物的方法在审
申请号: | 202111460788.0 | 申请日: | 2021-12-03 |
公开(公告)号: | CN114350763A | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 高复云;李雅颖;姚槐应 | 申请(专利权)人: | 中国科学院城市环境研究所 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/689;C12N15/11;G01N9/24 |
代理公司: | 浙江中桓联合知识产权代理有限公司 33255 | 代理人: | 朱萍 |
地址: | 361021 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 硝化 微生物 方法 | ||
1.一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
S1、对土壤进行预培养;
S2、取土壤分别加入14N-Urea、14N-(NH4)2SO4、15N-Urea和15N-(NH4)2SO4进行同位素微宇宙实验,分别孵育,然后分别提取土壤DNA;
S3、在DNA中加入CsCl溶液和GB溶液,调节折光率,然后进行超高速离心,然后进行分层纯化得到不同密度层级的DNA溶液;
S4、对DNA溶液每个密度层级进行折光率检测并计算浮力密度,经后处理再利用荧光定量PCR确定密度层级的amoA基因丰度;
S5、通过amoA基因丰度和浮力密度判断硝化微生物标记程度。
2.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S1土壤预培养为在20-30℃下保持55-65%土壤田间最大持水量5-8天。
3.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S2孵育过程土壤中含有90-110mg/kg的14N-Urea或14N-(NH4)2SO4或15N-Urea或15N-(NH4)2SO4。
4.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S3调整折光率为1.4015±0.0002。
5.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S3超高速离心转速设置为44000-46000rpm,离心力为180000-190000g,离心时间为45-50h。
6.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S3密度层级总层数为16层。
7.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S4后处理前每个密度层级需要加入PEG6000溶液进行静置处理。
8.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S4后处理具体为:对每个密度层级进行离心去上清,然后清洗干燥,最后溶解于无核酸水中。
9.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,荧光定量PCR中引物为:AOA引物CamoA 23F/616R、AOB引物amoA1F/2R、comammox clade A引物comA_244F/659R、comammox clade B引物comB_244F/659R。
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