[发明专利]一种鉴定硝化微生物的方法在审

专利信息
申请号: 202111460788.0 申请日: 2021-12-03
公开(公告)号: CN114350763A 公开(公告)日: 2022-04-15
发明(设计)人: 高复云;李雅颖;姚槐应 申请(专利权)人: 中国科学院城市环境研究所
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851;C12Q1/689;C12N15/11;G01N9/24
代理公司: 浙江中桓联合知识产权代理有限公司 33255 代理人: 朱萍
地址: 361021 福建*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 一种 鉴定 硝化 微生物 方法
【权利要求书】:

1.一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:

S1、对土壤进行预培养;

S2、取土壤分别加入14N-Urea、14N-(NH4)2SO415N-Urea和15N-(NH4)2SO4进行同位素微宇宙实验,分别孵育,然后分别提取土壤DNA;

S3、在DNA中加入CsCl溶液和GB溶液,调节折光率,然后进行超高速离心,然后进行分层纯化得到不同密度层级的DNA溶液;

S4、对DNA溶液每个密度层级进行折光率检测并计算浮力密度,经后处理再利用荧光定量PCR确定密度层级的amoA基因丰度;

S5、通过amoA基因丰度和浮力密度判断硝化微生物标记程度。

2.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S1土壤预培养为在20-30℃下保持55-65%土壤田间最大持水量5-8天。

3.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S2孵育过程土壤中含有90-110mg/kg的14N-Urea或14N-(NH4)2SO415N-Urea或15N-(NH4)2SO4

4.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S3调整折光率为1.4015±0.0002。

5.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S3超高速离心转速设置为44000-46000rpm,离心力为180000-190000g,离心时间为45-50h。

6.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S3密度层级总层数为16层。

7.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S4后处理前每个密度层级需要加入PEG6000溶液进行静置处理。

8.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,步骤S4后处理具体为:对每个密度层级进行离心去上清,然后清洗干燥,最后溶解于无核酸水中。

9.根据权利要求1所述的一种鉴定硝化微生物的方法,其特征在于,荧光定量PCR中引物为:AOA引物CamoA 23F/616R、AOB引物amoA1F/2R、comammox clade A引物comA_244F/659R、comammox clade B引物comB_244F/659R。

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