[发明专利]基于CRISPR-Cas12a传感系统的PPIs检测平台及检测方法在审

专利信息
申请号: 202111399079.6 申请日: 2021-11-19
公开(公告)号: CN114088952A 公开(公告)日: 2022-02-25
发明(设计)人: 于艳艳;朱敏;苏高星;徐梦婷;朱越东 申请(专利权)人: 南通大学
主分类号: G01N33/68 分类号: G01N33/68;G01N33/574;C12Q1/68
代理公司: 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 代理人: 曹振中
地址: 226001 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基于 crispr cas12a 传感 系统 ppis 检测 平台 方法
【权利要求书】:

1.一种基于CRISPR-Cas12a传感系统的PPIs检测平台,其特征在于,用于p53-MDM2相互作用监测和抑制剂疗效评价。

2.一种如权利要求1所述的基于CRISPR-Cas12a传感系统的PPIs检测平台的构建方法,其特征在于,将PAM结构域整合到特定的p53 DNA结合结构域中,将蛋白质相互作用事件转换到Cas12a的反式裂解活性中。

3.一种利用如权利要求1或2所述的基于CRISPR-Cas12a传感系统的PPIs检测平台的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:

S1、设计Cas-PPIor探针dsDNA,然后通过聚丙烯酰胺凝胶电泳验证p53与dsDNA的结合能力、p53和MDM2的结合能力以及Nutlin-3a对p53与MDM2结合的抑制效力,对Cas-PPIor可行性进行验证;

S2、Cas-PPIor用于p53-MDM2相互作用研究及抑制剂效力评价:Cas-PPIor用于检测不同浓度的p53-MDM2复合物,将p53的特异性DNA结合特性与Cas12a平台耦合,通过检测溶液中未结合p53的游离DNA, 对荧光数据进行拟合分析,从而得出p53-MDM2的KD值;选择Nutlin-3a来评估在竞争性结合实验中对p53-MDM2 相互作用的抑制;

S3、Cas-PPIor用于细胞内蛋白相互作用检测:磁珠捕获细胞中p53然后与激活序列结合,Cas-PPIor检测体系里剩余的激活链,从而从荧光水平间接得出细胞中蛋白相互作用水平。

4.根据权利要求3所述的基于CRISPR-Cas12a传感系统的PPIs检测方法,其特征在于,步骤S1中,Cas12a/sgRNA复合物和p53以竞争方式结合相同的dsDNA 探针,借助抗体修饰的磁珠,使结合的dsDNA探针与p53一起分离。

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