[发明专利]一套用于茶枝柑品系鉴定的分子标记及其应用有效

专利信息
申请号: 202111388078.1 申请日: 2021-11-22
公开(公告)号: CN114058728B 公开(公告)日: 2023-08-08
发明(设计)人: 陈钧义;蔡雪妍;刘伟;张群宇;陈杰湖;黄九九;林锐松;谢富瑞;李倩仪;李安琪;李怡霖;柏丽莹 申请(专利权)人: 华南农业大学;广州瑞科基因科技有限公司;广州美斛健生物技术有限公司;广东陈皮人家陈皮集团有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11;C12Q1/6806;G16B20/20;G06F18/2135
代理公司: 广州凯东知识产权代理有限公司 44259 代理人: 曾志环
地址: 510642*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一套 用于 茶枝柑 品系 鉴定 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.检测表2和表3所示的337个SNP位点分子标记的试剂在茶枝柑品系鉴定中的应用,所述茶枝柑的学名为Citrus reticulata cv. Chachiensis,所述茶枝柑品系为大洞5号、大种油身和细种油身;

表2和表3中,NO.是茶枝柑品系SNP位点代号;Chr是NCBI公共数据库中版本号为ASM325862v1的柑橘Citrus reticulata的染色体参考基因组序列号;Pos是相应SNP位点在染色体参考基因组序列上的位置;Ref是染色体参考基因组序列在相应SNP位点的碱基型;DDa、DDd、DDb、DDe、DDc、DDf、DDg、DDh、DZa、DZd、DZb、DZe、DZc、DZf、DZg、DZh、XZa、XZd、XZb、XZe、XZc、XZf、XZg、XZh中的两个字符代表每一行位点上的基因型;DZa-h是大种油身,DDa-h是大洞5号,XZa-h是细种油身。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:

步骤包括:将待测样品基因组DNA的所述337个SNP位点的基因型与表2-3所示的选取自大洞5号、大种油身和细种油身的3个茶枝柑品系的24个标准样品的所述337个SNP位点的基因型进行主成分分析(PCA),确定待测样品是否为所述茶枝柑品系的其中一个品系。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:

所述PCA分析是采用Genome-wide Complex TraitAnalysis版本1.26.0,计算PCA值,通过计算得到的PCA值绘制PCA图。

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