[发明专利]FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA联合作为肺腺癌生物标志物的用途有效
申请号: | 202111375737.8 | 申请日: | 2021-11-19 |
公开(公告)号: | CN114032308B | 公开(公告)日: | 2022-11-29 |
发明(设计)人: | 产天龙;徐祎春;韩峻松;袁箐;苏军;周佳菁 | 申请(专利权)人: | 上海生物芯片有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 许亦琳;余明伟 |
地址: | 201203 上海市浦东新区中国*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | fam83a kpna2 krt6a ldha 联合 作为 腺癌 生物 标志 用途 | ||
1.FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA作为肺腺癌标志物在制备肺腺癌预后评估的产品中的应用,所述肺腺癌预后评估的产品采用cox回归分析方法,预测FAM83A、KPNA2、KRT6A、LDHA共表达的联合效应对病人预后风险的影响。
2.用于检测FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA的物质在制备肺腺癌预后评估的产品中的应用,所述肺腺癌预后评估的产品采用cox回归分析方法,预测FAM83A、KPNA2、KRT6A、LDHA共表达的联合效应对病人预后风险的影响。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述物质包括如下1)~4)中的一项或多项:
1)序列如SEQ ID NO.1所示的FAM83A基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.2所示的FAM83A基因定量PCR反向引物;
2)序列如SEQ ID NO.3所示的KPNA2基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.4所示的KPNA2基因定量PCR反向引物;
3)序列如SEQ ID NO.5所示的KRT6A基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.6所示的KRT6A基因定量PCR反向引物;
4)序列如SEQ ID NO.7所示的LDHA基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.8所示的LDHA基因定量PCR反向引物。
4.一种肺腺癌预后评估的产品,其特征在于,所述产品包括检测FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA的物质,所述肺腺癌预后评估的产品采用cox回归分析方法,预测FAM83A、KPNA2、KRT6A、LDHA共表达的联合效应对病人预后风险的影响。
5.如权利要求4所述的产品,其特征在于,所述物质包括如下1)~4)中的一项或多项:
1)序列如SEQ ID NO.1所示的FAM83A基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.2所示的FAM83A基因定量PCR反向引物;
2)序列如SEQ ID NO.3所示的KPNA2基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.4所示的KPNA2基因定量PCR反向引物;
3)序列如SEQ ID NO.5所示的KRT6A基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.6所示的KRT6A基因定量PCR反向引物;
4)序列如SEQ ID NO.7所示的LDHA基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.8所示的LDHA基因定量PCR反向引物。
6.如权利要求4或5所述的产品,其特征在于,所述产品为试剂盒;和/或,所述预后包括肺腺癌复发及预后的辅助判断。
7.一种对肺腺癌进行诊断和/或进行预后评估的系统,其特征在于,所述系统包括:
cox模型方程获得模块:提供cox模型方程,所述cox模型方程是根据FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA的表达水平,调用R平台coxph,进行多因素生存预测分析,得到cox模型方程;
cox模型预测值和风险中位值获得模块:根据测序方法获得的待测样本的FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA的表达量,代入所述cox模型方程,得到cox模型预测值,即cox模型风险值,同时获得cox模型风险中位值;
预测模块:如果cox模型风险值大于所述cox模型风险中位值,即预测为肺腺癌高风险,反之,则预测为肺腺癌低风险。
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