[发明专利]低频引入突变的酶切打断建库方法和试剂盒在审
申请号: | 202111296374.9 | 申请日: | 2021-11-03 |
公开(公告)号: | CN113832549A | 公开(公告)日: | 2021-12-24 |
发明(设计)人: | 曲燕;胡玉刚;吴强 | 申请(专利权)人: | 纳昂达(南京)生物科技有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 白雪 |
地址: | 210031 江苏省南京市江北新区华康路*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 低频 引入 突变 打断 方法 试剂盒 | ||
1.一种低频引入突变的酶切打断建库方法,其特征在于,包括DNA酶切片段化和补平加A、接头连接、PCR扩增和文库纯化的步骤,其中,所述DNA酶切片段化和补平加A步骤中,通过控制常温DNA聚合酶的用量控制反复切割和链置换。
2.根据权利要求1所述的酶切打断建库方法,其特征在于,所述DNA酶切片段化和补平加A步骤中,所述常温DNA聚合酶的用量为0.001~0.045U/μL;
优选的,所述常温DNA聚合酶为选自大肠杆菌聚合酶I、Klenow大片段或Bst DNA聚合酶中的一种或多种。
3.根据权利要求1所述的酶切打断建库方法,其特征在于,所述DNA酶切片段化和补平加A步骤中,耐热DNA聚合酶的用量为0.05~0.2U/μL;
优选的,所述耐热DNA聚合酶为Taq DNA聚合酶。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的酶切打断建库方法,其特征在于,所述DNA酶切片段化和补平加A步骤中,所述常温DNA聚合酶的反应温度为25~32℃;优选为25℃;
优选的,所述常温DNA聚合酶的灭活温度为65℃;
优选的,所述常温DNA聚合酶的反应时间为25~30min;
优选的,所述常温DNA聚合酶的灭活反应时间为25~30min。
5.根据权利要求1所述的酶切打断建库方法,其特征在于,所述DNA酶切片段化和补平加A步骤中,打断酶溶液包括T4 GP32 0.01~0.03μg/μL、DNaseI 0.004~0.01U/μL、KlenowDNA聚合酶0.001~0.045U/μL、Taq DNA聚合酶0.05~0.2U/μLU/μL和50%甘油;
优选的,所述打断酶溶液包括T4 GP32 0.01μg/μL、DNase I 0.004U/μL、Klenow DNA聚合酶0.045U/μL、Taq DNA聚合酶0.2U/μL和50%甘油。
6.根据权利要求5所述的酶切打断建库方法,其特征在于,所述DNA酶切片段化和补平加A步骤中,所用的打断酶缓冲液包括Tris-HCl 5~15mM、NaCl 20~40mM、MgCl2 3~8mM、CaCl2 1~3mM、MnCl2 1~3mM、dNTPs 0.6~1mM、ATP 5~15mM;
优选的,所述打断酶缓冲液包括Tris-HCl 10mM、NaCl 30mM、MgCl2 5mM、CaCl22mM、MnCl2 2mM、dNTPs 0.6mM、ATP 10mM。
7.根据权利要求5或6所述的酶切打断建库方法,其特征在于,所述酶切打断建库方法包括:取所述打断酶缓冲液和所述打断酶溶液混合得到打断体系,向所述打断体系中加入待打断的DNA样本,25~32℃反应25~30min,然后65℃反应25~30min。
8.一种低频引入突变的酶切打断建库试剂盒,其特征在于,包括打断酶溶液和打断酶缓冲液:所述打断酶溶液包括常温DNA聚合酶,所述常温DNA聚合酶的反应终浓度为0.001~0.045U/μL;
更优选的,所述常温DNA聚合酶为选自大肠杆菌聚合酶I、Klenow大片段或Bst DNA聚合酶中的一种或多种;
优选的,所述打断酶溶液还包括耐热DNA聚合酶,所述耐热DNA聚合酶的反应终浓度为0.05~0.2U/μL;
更优选的,所述耐热DNA聚合酶为Taq DNA聚合酶。
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