[发明专利]用于有毒蘑菇环鳞鹅膏鉴定的引物组、试剂盒和方法有效
申请号: | 202111279445.4 | 申请日: | 2021-10-29 |
公开(公告)号: | CN114058726B | 公开(公告)日: | 2022-08-12 |
发明(设计)人: | 张玉;姜帆;朱水芳;石俊霞;王超楠 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京百欧知识产权代理事务所(普通合伙) 11930 | 代理人: | 邹晓艳 |
地址: | 100176 北京市大*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 有毒 蘑菇 环鳞鹅膏 鉴定 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种鉴定有毒蘑菇环鳞鹅膏的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)提取待测样品的基因组DNA;
2)采用引物组对提取的基因组DNA进行PCR扩增;
3)检测PCR扩增产物中是否含有目的扩增片段,含有目的扩增片段的样品鉴定为环鳞鹅膏阳性,所述目的扩增片段的大小为341bp;
所述引物组包括引物AconF、qAconR,其核苷酸序列为:
AconF:GTCTCTCTTCTTGCTTGTTTC,
qAconR:AAATCCAAAACACACTCAAAAAGAGC。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应体系为:总体积25μl,其中,2×Taq PCR MasterMix 12.5μl、浓度为10μM的正反向引物各1μl、基因组DNA 1μl、余量为ddH2O;
所述步骤2)中PCR扩增的反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,35个循环。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤3)中采用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物中是否含有目的条带。
4.一种鉴定有毒蘑菇环鳞鹅膏的实时荧光PCR方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)提取待测样品的基因组DNA;
2)采用引物组对提取的基因组DNA进行实时荧光PCR扩增,根据扩增结果判断待测对象是否含有环鳞鹅膏,如果Ct≤30则判断为环鳞鹅膏阳性;
所述引物组包括引物AconF、qAconR,其核苷酸序列为:
AconF:GTCTCTCTTCTTGCTTGTTTC,
qAconR:AAATCCAAAACACACTCAAAAAGAGC,
所述引物组还包括探针AconU,探针AconU的核苷酸序列为:AGGCAGCCTTGGCACTGTTCAGGT;
探针AconU的5’端标记荧光报告基团,3’端标记荧光淬灭基团。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述实时荧光PCR的反应体系为:总体积20μl,其中2×T5 Fast qPCR Mix 10μl、浓度为10μM的引物AconF/qAconR各1μl、浓度为10μM的探针AconU 0.5μl、基因组DNA 1μl,余量为ddH2O;qPCR扩增程序为:95℃10min;95℃10s,60℃40s,40个循环。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述荧光报告基团为VIC,所述荧光淬灭基团为BHQ1。
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