[发明专利]一种分子检测方法在审
| 申请号: | 202111234491.2 | 申请日: | 2021-10-22 |
| 公开(公告)号: | CN113801919A | 公开(公告)日: | 2021-12-17 |
| 发明(设计)人: | 朱先伟;王倩;闪烨 | 申请(专利权)人: | 朱先伟 |
| 主分类号: | C12Q1/6837 | 分类号: | C12Q1/6837 |
| 代理公司: | 西安合创非凡知识产权代理事务所(普通合伙) 61248 | 代理人: | 张翠华 |
| 地址: | 250000 山东省济*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 分子 检测 方法 | ||
1.一种分子检测方法,其特征在于:基于SPR分析仪上完成分子检测分析,首先,在载有用于检测的核糖核酸(RNA)探针微阵列的SPR芯片上,使用具有链置换活性的DNA聚合酶、扩增引物等对检测分子进行恒温扩增获得单链DNA扩增产物;若检测分子中含有阳性序列,则单链DNA扩增产物会与SPR芯片上的互补核糖核酸探针杂交;随后,反应混合液中的RNaseH会特异性分解与单链DNA扩增产物杂交的核糖核酸探针,SPR芯片上的探针被分解后,对应区域的SPR条件将发生改变,最终对应区域反射光的强度将发生变化。
2.如权利要求1所述的一种分子检测方法,其特征在于:单链DNA扩增产物的扩增包括以下步骤:
制备选自下组的反应混合物
(a)含有目标(模板)的核酸、脱氧核糖核苷三磷酸、具有链置换活性的DNA聚合酶、至少两种扩增引物和具有RNase H活性的酶或催化剂等可以反应生成单链DNA的反应扩增混合物;或
(b)含有目标(模板)的核酸、脱氧核糖核苷三磷酸、核糖核苷三磷酸、至少两种扩增引物、Reverse transcriptase、RNA polymerase和具有RNase H活性的酶或催化剂等可以反应生成单链DNA的反应扩增混合物;或
(c)含有目标(模板)的核酸、含有至少两种扩增引物、例如但不限于具有RNase H活性的各种酶或催化剂等的可以反应生成单链DNA或形成可与芯片表面探针杂交的状态的反应混合物;或
(d)含有目标(模板)的核酸的通过改变温度、溶液离子强度、pH等变性成单链DNA或形成可与芯片表面探针杂交的状态的含有例如但不限于具有RNase H活性的酶或催化剂的反应混合物;
在恒温或温度变化等的条件下,将目标(模板)的核酸扩增生成单链DNA或变性成单链DNA或形成可与芯片表面探针杂交的状态。
3.如权利要求2所述的一种分子检测方法,其特征在于:当使用反应混合物(a)、(b)或(c)时,作为目标(模板)的核酸为DNA或RNA;当目标(模板)的核酸是RNA时,需事先用脱氧核糖核苷三磷酸、具有逆转录活性的酶和至少引物处理核酸,以便将核酸转化为逆转录产物;同时,反应混合物可以含有具有逆转录活性的酶,也可以使用单一的具有逆转录酶活性和链置换活性的DNA聚合酶。
4.如权利要求1所述的一种分子检测方法,其特征在于:互补核糖核酸探针的构成可采用以下形式:
(a)探针全部由核糖核酸(RNA)构成;
(b)探针由核糖核酸(RNA)与脱氧核糖核酸(DNA)构成。
5.如权利要求1所述的一种分子检测方法,其特征在于:基因芯片相关的制备方法﹑芯片材质﹑形态:
(a)基因芯片的制备可采用但不限于原位合成﹑探针吸附固定﹑探针共价偶联固定;
(b)基因芯片的材质可采用但不限于玻璃,PMMA,硝酸纤维素膜﹑聚偏二氟乙烯膜﹑SPR芯片﹑芯片复合材质﹑磁珠﹑各种材质的纳米颗粒;
(c)基因芯片的形态可采用但不限于由一种或多种探针微阵列构成﹑基因芯片与其它种类芯片复合构成﹑纳米颗粒型基因芯片﹑微流控复合型基因芯片;
(d)其它芯片领域内的不同形式。
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