[发明专利]U型接头及采用U型接头介导的磁珠偶联转座酶进行RNA快速均一化建库的方法有效

专利信息
申请号: 202111221496.1 申请日: 2021-10-20
公开(公告)号: CN113943729B 公开(公告)日: 2023-05-16
发明(设计)人: 宋东亮;孙睿;江翱;陈晶晶;曹振;王嫚;刘倩;侯策 申请(专利权)人: 翌圣生物科技(上海)股份有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C40B80/00;C12Q1/6806;C40B50/06
代理公司: 苏州根号专利代理事务所(普通合伙) 32276 代理人: 朱华庆
地址: 200120 上海市浦*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 接头 采用 磁珠偶联转座酶 进行 rna 快速 均一 化建库 方法
【权利要求书】:

1.一种用于结合磁珠并偶联转座酶的U型接头,所述U形接头为:5’-[Phos] CTGTCTCTTATACACATCTNNNNNNNNAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTT[Int NH2 C6 dT]TTTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTA

GATGTGTATAAGAGACAG-3’、 5’-GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGAT

CTNNNNNNNNAGATGTGTATAAGAGACAG-3’以及5’-[Phos] -CTGTCTCTTATACA

CAAGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT-3’三条寡核苷酸序列的退火产物,磁珠为羧基磁珠。

2.根据权利要求1所述的U型接头,其特征在于三条寡核苷酸中,长寡核苷酸与两条短寡核苷酸的摩尔量比为1:3:3-1:10:10。

3.根据权利要求1或2所述的U型接头,其特征在于U型接头的退火程序为95℃ 5 min,90℃ 5 min,85℃ 5 min,80℃ 5 min,75℃ 1 h,4℃ hold。

4.一种采用U型接头介导的磁珠偶联转座酶进行RNA快速均一化建库的方法,其特征在于其步骤包括:

(1)使用随机引物对RNA样本进行逆转录,得到DNA/RNA杂交链;

(2)使用U型接头介导的磁珠偶联转座酶对DNA/RNA杂交链进行片段化反应;

(3)片段化产物末端修复和文库扩增;

其中所述的U型接头为权利要求1、2或3所述的U型接头。

5.根据权利要求4所述的采用U型接头介导的磁珠偶联转座酶进行RNA快速均一化建库的方法,其特征在于逆转录反应使用随机引物N8,逆转录反应使用翌圣生物的Hifair® ⅡReverse Transcriptase;反应程序为25℃ 10 min,42℃ 30 min,85℃ 5 min。

6.根据权利要求5所述的采用U型接头介导的磁珠偶联转座酶进行RNA快速均一化建库的方法,其特征在于逆转录反应中还加入rRNA的逆转录阻碍探针。

7.根据权利要求4所述的采用U型接头介导的磁珠偶联转座酶进行RNA快速均一化建库的方法,其特征在于片段化反应条件为55℃反应10-30 min。

8.根据权利要求4所述的采用U型接头介导的磁珠偶联转座酶进行RNA快速均一化建库的方法,其特征在于片段化产物末端修复和文库扩增同时进行,末端修复使用逆转录酶,文库扩增使用翌圣生物的2×Hieff Canace® Gold PCR Master Mix高保真酶预混液,反应温度为40-65℃,反应时间为10-30 min。

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