[发明专利]检测松材线虫的LAMP引物、检测方法及LAMP检测试剂盒在审
申请号: | 202111217721.4 | 申请日: | 2021-10-19 |
公开(公告)号: | CN114015784A | 公开(公告)日: | 2022-02-08 |
发明(设计)人: | 孟繁丽;刘振凯;理永霞;张星耀 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 北京思元知识产权代理事务所(普通合伙) 11598 | 代理人: | 余光军;霍雪梅 |
地址: | 100083 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 松材线虫 lamp 引物 方法 试剂盒 | ||
1.用于检测松材线虫的LAMP引物组,其特征在于,选自以下4组LAMP引物组中的任意一组:
2号LAMP引物组:由一对外引物对,一对内引物对和一对环引物对组成,其中,所述外引物对由上游外部引物SEQ ID NO.7和下游外部引物SEQ ID NO.8组成,所述内引物对由上游内部引物SEQ ID NO.9和下游内部引物SEQ ID NO.10组成,所述环引物对由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示的环引物组成;
3号LAMP引物组:由一对外引物对,一对内引物对和一对环引物对组成,其中,所述外引物对由上游外部引物SEQ ID NO.13和下游外部引物SEQ ID NO.14组成,所述内引物对由上游内部引物SEQ ID NO.15和下游内部引物SEQ ID NO.16组成,所述环引物对由SEQ IDNO.17和SEQ ID NO.18所示的环引物组成;
6号LAMP引物组:由一对外引物对,一对内引物对和一对环引物对组成,其中,所述外引物对由上游外部引物SEQ ID NO.31和下游外部引物SEQ ID NO.32组成,所述内引物对由上游内部引物SEQ ID NO.33和下游内部引物SEQ ID NO.34组成,所述环引物对由SEQ IDNO.35和SEQ ID NO.36所示的环引物组成;
7号LAMP引物组:由一对外引物对,一对内引物对和一对环引物对组成,其中,所述外引物对由上游外部引物SEQ ID NO.37和下游外部引物SEQ ID NO.38组成,所述内引物对由上游内部引物SEQ ID NO.39和下游内部引物SEQ ID NO.40组成,所述环引物对由SEQ IDNO.41和SEQ ID NO.42所示的环引物组成。
2.根据权利要求1所述的LAMP引物组,其特征在于,所述的LAMP引物组是6号LAMP引物组。
3.权利要求1或2所述的LAMP引物组在检测松材线虫中的应用。
4.一种检测松材线虫的LAMP检测方法,其特征在于,包括:
(1)从待检测的松树样品中提取DNA;(2)以提取的DNA为模板加入包括LAMP引物组、BstDNA聚合酶在内的组分建立LAMP反应体系,进行实时荧光PCR扩增;(3)于63℃45s处收集荧光信号,若有“S”型扩增曲线,则判断为阳性,即有核酸扩增;若无“S”型扩增曲线,则判断为阴性,即无核酸扩增。
5.根据权利要求4所述的LAMP检测方法,其特征在于,步骤(2)中所述的实时荧光PCR扩增的反应程序为63℃15s,63℃45s作为一个扩增循环。
6.根据权利要求4所述的LAMP检测方法,其特征在于,所述的松树是任何一种被松材线虫侵染的松树,包括但不限于:马尾松、白皮松、樟子松、五针松、黑松、红松、油松、乔松、赤松、琉球松、欧洲黑松、海岸松、欧洲山松、辐射松、西黄松、西部白松、中国台湾黑松、湿地松、刚松、扭叶松、北美乔松、火炬松、长叶松、北美短叶松、刺叶松或加勒比松。
7.一种检测松材线虫的LAMP试剂盒,该试剂盒包括:LAMP引物组,Bst DNA聚合酶,LAMP反应缓冲液,dNTPs和荧光染料;其特征在于,所述的LAMP引物组是权利要求1或2所述的LAMP引物组。
8.根据权利要求7所述的LAMP试剂盒,其特征在于,所述的荧光染料是SYBR GreenI。
9.权利要求8或9所述的LAMP试剂盒在检测松材线虫中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,包括:(1)从待检测的松树样品中提取待检测样品的DNA,以该DNA为模板建立LAMP反应体系;(2)将LAMP反应体系进行实时荧光PCR扩增;(3)于63℃45s处收集荧光信号,若有“S”型扩增曲线,则判断为阳性,即有核酸扩增;若无“S”型扩增曲线,则判断为阴性,即无核酸扩增。
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