[发明专利]检测松材线虫的LAMP引物、检测方法及LAMP检测试剂盒在审

专利信息
申请号: 202111217721.4 申请日: 2021-10-19
公开(公告)号: CN114015784A 公开(公告)日: 2022-02-08
发明(设计)人: 孟繁丽;刘振凯;理永霞;张星耀 申请(专利权)人: 北京林业大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6844;C12N15/11
代理公司: 北京思元知识产权代理事务所(普通合伙) 11598 代理人: 余光军;霍雪梅
地址: 100083 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 检测 松材线虫 lamp 引物 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.用于检测松材线虫的LAMP引物组,其特征在于,选自以下4组LAMP引物组中的任意一组:

2号LAMP引物组:由一对外引物对,一对内引物对和一对环引物对组成,其中,所述外引物对由上游外部引物SEQ ID NO.7和下游外部引物SEQ ID NO.8组成,所述内引物对由上游内部引物SEQ ID NO.9和下游内部引物SEQ ID NO.10组成,所述环引物对由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示的环引物组成;

3号LAMP引物组:由一对外引物对,一对内引物对和一对环引物对组成,其中,所述外引物对由上游外部引物SEQ ID NO.13和下游外部引物SEQ ID NO.14组成,所述内引物对由上游内部引物SEQ ID NO.15和下游内部引物SEQ ID NO.16组成,所述环引物对由SEQ IDNO.17和SEQ ID NO.18所示的环引物组成;

6号LAMP引物组:由一对外引物对,一对内引物对和一对环引物对组成,其中,所述外引物对由上游外部引物SEQ ID NO.31和下游外部引物SEQ ID NO.32组成,所述内引物对由上游内部引物SEQ ID NO.33和下游内部引物SEQ ID NO.34组成,所述环引物对由SEQ IDNO.35和SEQ ID NO.36所示的环引物组成;

7号LAMP引物组:由一对外引物对,一对内引物对和一对环引物对组成,其中,所述外引物对由上游外部引物SEQ ID NO.37和下游外部引物SEQ ID NO.38组成,所述内引物对由上游内部引物SEQ ID NO.39和下游内部引物SEQ ID NO.40组成,所述环引物对由SEQ IDNO.41和SEQ ID NO.42所示的环引物组成。

2.根据权利要求1所述的LAMP引物组,其特征在于,所述的LAMP引物组是6号LAMP引物组。

3.权利要求1或2所述的LAMP引物组在检测松材线虫中的应用。

4.一种检测松材线虫的LAMP检测方法,其特征在于,包括:

(1)从待检测的松树样品中提取DNA;(2)以提取的DNA为模板加入包括LAMP引物组、BstDNA聚合酶在内的组分建立LAMP反应体系,进行实时荧光PCR扩增;(3)于63℃45s处收集荧光信号,若有“S”型扩增曲线,则判断为阳性,即有核酸扩增;若无“S”型扩增曲线,则判断为阴性,即无核酸扩增。

5.根据权利要求4所述的LAMP检测方法,其特征在于,步骤(2)中所述的实时荧光PCR扩增的反应程序为63℃15s,63℃45s作为一个扩增循环。

6.根据权利要求4所述的LAMP检测方法,其特征在于,所述的松树是任何一种被松材线虫侵染的松树,包括但不限于:马尾松、白皮松、樟子松、五针松、黑松、红松、油松、乔松、赤松、琉球松、欧洲黑松、海岸松、欧洲山松、辐射松、西黄松、西部白松、中国台湾黑松、湿地松、刚松、扭叶松、北美乔松、火炬松、长叶松、北美短叶松、刺叶松或加勒比松。

7.一种检测松材线虫的LAMP试剂盒,该试剂盒包括:LAMP引物组,Bst DNA聚合酶,LAMP反应缓冲液,dNTPs和荧光染料;其特征在于,所述的LAMP引物组是权利要求1或2所述的LAMP引物组。

8.根据权利要求7所述的LAMP试剂盒,其特征在于,所述的荧光染料是SYBR GreenI。

9.权利要求8或9所述的LAMP试剂盒在检测松材线虫中的应用。

10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,包括:(1)从待检测的松树样品中提取待检测样品的DNA,以该DNA为模板建立LAMP反应体系;(2)将LAMP反应体系进行实时荧光PCR扩增;(3)于63℃45s处收集荧光信号,若有“S”型扩增曲线,则判断为阳性,即有核酸扩增;若无“S”型扩增曲线,则判断为阴性,即无核酸扩增。

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