[发明专利]一种快速鉴定和定量肠炎沙门菌的探针法双重荧光定量PCR引物组及试剂盒在审
申请号: | 202111204657.6 | 申请日: | 2021-10-15 |
公开(公告)号: | CN113755617A | 公开(公告)日: | 2021-12-07 |
发明(设计)人: | 焦新安;潘志明;熊丹;宋丽;周懿;刘博闻;顾丹;康喜龙;孟闯 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/42 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 王秋霞;许亦琳 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 鉴定 定量 肠炎 沙门 探针 双重 荧光 pcr 引物 试剂盒 | ||
1.一种检测肠炎沙门菌的PCR引物组,其特征在于,所述PCR引物组中包括用于分别检测lygD基因和invA基因的引物对。
2.根据权利要求1所述的PCR引物组,其特征在于,所述PCR引物组中包括以下中的任一项或多项:
1)第一引物对:包括核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的上游引物与核苷酸序列如SEQIDNO:2所示的下游引物;
2)第一探针引物:核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
3)第二引物对:包括核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示的上游引物与核苷酸序列如SEQIDNO:5所示的下游引物;
4)第二探针引物:核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。
3.根据权利要求2所述的PCR引物组,其特征在于,所述第一探针引物和第二探针引物5’端标记有不同的荧光报告基团,3’端标记有不同的荧光淬灭基团。
4.权利要求1-3任一所述的PCR引物组在制备lygD基因和invA基因检测产品中的用途。
5.根据权利要求4所述的用途,其特征在于,所述lygD基因和invA基因检测产品为肠炎沙门菌鉴定或定量产品。
6.根据权利要求5所述的用途,其特征在于,所述肠炎沙门菌鉴定或定量产品为试剂盒。
7.一种检测肠炎沙门菌的探针法双重荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1-3任一所述的PCR引物组。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括水、Premix ExTaqMaster、ROX Reference Dye II、阳性对照DNA、阴性对照DNA、样品基因组DNA提取试剂中的一种或多种。
9.权利要求1-3任一所述的引物组或权利要求7所述的试剂盒在鉴定和定量检测肠炎沙门菌中的用途。
10.一种肠炎沙门菌的鉴定方法,其特征在于,所述鉴定方法包括如下步骤:
1)配制PCR反应体系:利用权利要求7或8所述的探针法双重荧光定量PCR检测试剂盒和待测样品的基因组DNA配制PCR反应体系;
2)PCR反应:将配制完成的PCR反应体系进行PCR扩增;
3)结果分析:能同时扩增出lygD基因和invA基因的待测样品即为肠炎沙门菌,不能同时扩增出lygD基因和invA基因的待测样品即不是肠炎沙门菌。
11.根据权利要求10所述的鉴定方法,其特征在于,还包括以下特征中的一项或多项:
1)所述待测样品选自食物、水、家禽;
2)步骤1)中配制的PCR反应体系包括待测样品的反应体系、阳性对照的反应体系、阴性对照的反应体系;
3)所述PCR反应体系为25μL体系,其中包括:2×Premix Ex Taq Master 12.5μL,lygD-F240nM,lygD-R 240nM,lygD-P 100nM,invA-F 200nM,invA-R 200nM,invA-P 80nM,DNA模板2.5μL,ROX Reference Dye II 0.25μL,ddH2O补至25μL;
4)PCR反应的条件为:(a)95℃30s;(b)95℃5s;(c)60℃34s,步骤(b)~(c)循环40次。
12.一种定量检测肠炎沙门菌的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
1)配制标准曲线的PCR反应体系:将权利要求8所述的探针法双重荧光定量PCR检测试剂盒中的阳性对照DNA梯度稀释,以梯度稀释后的阳性对照DNA分别作为模板配制标准曲线的反应体系;
2)配制待测样品的PCR反应体系:以待测样品的基因组DNA为模板,利用权利要求8所述的探针法双重荧光定量PCR检测试剂盒配制待测样品的PCR反应体系;
3)配制阴性对照的PCR反应体系:以权利要求8所述的探针法双重荧光定量PCR检测试剂盒中的阴性对照DNA为模板配制阴性对照的PCR反应体系;
4)PCR反应:将配制完成的各PCR反应体系进行PCR扩增;
5)结果分析:通过各PCR反应体系的扩增信号,代入标准曲线计算待测样品中肠炎沙门菌的含量。
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