[发明专利]基于TaHDA9-D基因中A2173T SNP位点鉴定小麦每穗小穗数的方法

权利要求书

1.一种筛选或辅助筛选不同每穗小穗数小麦的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于TaHDA9-D基因的基因型为基因型I还是基因型II，基因型I小麦的每穗小穗数基因型II小麦的每穗小穗数；

所述基因型I的小麦为基于A2173T SNP位点的基因型为AA纯合型的小麦；

所述基因型II的小麦为基于A2173T SNP位点的基因型为TT纯合型的小麦；

所述A2173T SNP位点为小麦基因组中SEQ ID NO:1自5’末端起的第2173位核苷酸。

2.一种筛选或辅助筛选不同每穗小穗数小麦的方法，依次包括如下步骤：

(A1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用引物F1和引物R1组成的引物对甲进行PCR扩增，得到PCR扩增产物P1；

(A2)以所述PCR扩增产物P1为模板，采用引物F2和引物R2组成的引物对乙进行PCR扩增，得到PCR扩增产物P2；

(A3)将所述PCR扩增产物P2用限制性内切酶BglII进行酶切，得到酶切产物；然后进行如下评判：如果所述酶切产物为一条DNA片段，则待测小麦基于TaHDA9-D基因的基因型为基因型I；如果所述酶切产物为两条DNA片段，则待测小麦基于TaHDA9-D基因的基因型为基因型II；

基因型I的小麦的每穗小穗数基因型II的小麦的每穗小穗数；

所述引物F1为SEQ ID NO:4所示的单链DNA分子；

所述引物R1为SEQ ID NO:5所示的单链DNA分子；

所述引物F2为SEQ ID NO:6所示的单链DNA分子；

所述引物R2为SEQ ID NO:7所示的单链DNA分子。

3.一种筛选或辅助筛选不同每穗小穗数小麦的方法，依次包括如下步骤：

(B1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用引物F1和引物R1组成的引物对甲进行PCR扩增，得到PCR扩增产物P1；

(B2)以所述PCR扩增产物P1为模板，采用引物F2和引物R2组成的引物对乙进行PCR扩增，得到PCR扩增产物P2；

(B3)将所述PCR扩增产物P2用限制性内切酶BglII进行酶切，得到酶切产物；然后进行如下评判：如果所述酶切产物中只具有100bp的DNA片段，则待测小麦基于TaHDA9-D基因的基因型为基因型I；如果所述酶切产物中只具有79bp的DNA片段和21bp的DNA片段，则待测小麦基于TaHDA9-D基因的基因型为基因型II；

基因型I的小麦的每穗小穗数基因型II的小麦的每穗小穗数；

所述引物F1为SEQ ID NO:4所示的单链DNA分子；

所述引物R1为SEQ ID NO:5所示的单链DNA分子；

所述引物F2为SEQ ID NO:6所示的单链DNA分子；

所述引物R2为SEQ ID NO:7所示的单链DNA分子。

4.一种筛选或辅助筛选不同每穗小穗数小麦的方法，依次包括如下步骤：

(C1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用引物F1和引物R1组成的引物对甲进行PCR扩增，得到PCR扩增产物P1；

所述引物F1为SEQ ID NO:4所示的单链DNA分子；

所述引物R1为SEQ ID NO:5所示的单链DNA分子；

(C2)将所述PCR扩增产物P1进行测序，然后进行如下评判：

如果所述PCR扩增产物P1的核苷酸序列如SEQ ID NO:2自5’末端起第1777-2577位所示，则待测小麦基于TaHDA9-D基因的基因型为基因型I；

如果所述PCR扩增产物P1的核苷酸序列如SEQ ID NO:3自5’末端起第1777-2577位所示，则待测小麦基于TaHDA9-D基因的基因型为基因型II；

基因型I的小麦的每穗小穗数基因型II的小麦的每穗小穗数。