[发明专利]一种基于PMA-双重ddPCR的副溶血性弧菌定量检测方法在审
| 申请号: | 202111153909.7 | 申请日: | 2021-09-29 |
| 公开(公告)号: | CN113637733A | 公开(公告)日: | 2021-11-12 |
| 发明(设计)人: | 杨军;周海波;刘新梅;别小妹;程逸宇;吴海晶;刘延 | 申请(专利权)人: | 南京市食品药品监督检验院 |
| 主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/689;C12Q1/06;C12N15/11 |
| 代理公司: | 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 | 代理人: | 仇钰莹 |
| 地址: | 211198 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 pma 双重 ddpcr 溶血 弧菌 定量 检测 方法 | ||
1.一种检测试剂,其特征在于,包括引物组合A和引物组合B,
所述引物组合A包括上游引物,下游引物和探针,所述上游引物、下游引物和探针的序列如下所示:
上游引物:TTGAGTATTCAAGGTGCTTTGTAT;
下游引物:CATCAATCATCCACTCGGTAG;
探针:CTGCGAATTTGACTGCTGAGGCT;
所述探针的5’端用FAM修饰,3’端用BHQ1修饰;其中,FAM表示荧光报告基团,BHQ1表示淬灭基团;
所述引物组合B包括上游引物,下游引物和探针,所述上游引物、下游引物和探针的序列如下所示:
上游引物:GTGCGAAAGTGCTTGAGATG;
下游引物:TCGAACAAGGCGTGAGTATC;
探针:CGAGTTCATCAAGGCACAAGCGA;
所述探针的5’端用HEX修饰,3’端用BHQ1修饰;其中,HEX表示荧光报告基团,BHQ1表示淬灭基团。
2.一种检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的检测试剂。
3.根据权利要求2所述的一种检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括ddPCR扩增反应所需的辅助试剂和叠氮溴化丙锭。
4.一种检测副溶血性弧菌的方法,其特征在于,所述方法为,使用PMA预处理待测样本,并利用权利要求1所述的检测试剂或权利要求2或3所述的检测试剂盒进行双重ddPCR。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述预处理为将PMA与待测样本混匀并避光孵育不少于5min后,光照处理不少于15min。
6.根据权利要求4或5所述的方法,其特征在于,所述PMA的终浓度为28~32μmol/L。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述双重ddPCR的反应体系中,总体系为20μL,包括:ddPCR Supermix for Probes(No dUTP)10μL,引物组合A和引物组合B的上、下游引物各1.0μL,探针各0.5μL,DNA模板4μL,最后用水补足至20μL。
8.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述引物探针比例为1:0.25~1:2。
9.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述双重ddPCR的扩增条件为:95℃10min;94℃30s;58~62℃1min,40~60个循环;98℃10min;4℃保存。
10.权利要求1所述检测试剂、权利要求2或3所述检测试剂盒和权利要求4~9任一所述方法在食品卫生和环境监测中的应用。
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