[发明专利]与术前放化疗联合全直肠系膜切除术敏感性相关的基因及其应用在审

专利信息
申请号: 202111145602.2 申请日: 2021-09-28
公开(公告)号: CN113817826A 公开(公告)日: 2021-12-21
发明(设计)人: 杨承刚;范冰燕 申请(专利权)人: 青岛泱深生物医药有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;G01N33/574;A61K45/00;A61P35/00;G16H20/40;G16B50/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 266000 山东省青岛市崂山区科苑纬*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 术前放 化疗 联合 肠系膜 切除 敏感性 相关 基因 及其 应用
【权利要求书】:

1.检测样本中生物标志物表达水平的试剂在制备用于预测直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的产品中的应用,其特征在于,所述生物标志物为ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂包括检测样本中所述生物标志物的mRNA表达水平的试剂、检测样本中所述生物标志物编码的多肽和/或蛋白表达水平的试剂。

3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述试剂选自:

特异性识别所述生物标志物的探针;或

特异性扩增所述生物标志物的引物;或

特异性结合所述生物标志物的配体、抗体、抗体片段、亲和性蛋白。

4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述产品包括通过实时定量PCR、RT-PCR、免疫检测、原位杂交、芯片检测样本中所述生物标志物表达水平的试剂;

优选地,所述样本来源于组织。

5.一种用于预测直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含检测样本中生物标志物表达水平的试剂,所述生物标志物为ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12;

优选地,所述检测样本中生物标志物表达水平的试剂包括检测样本中所述生物标志物的mRNA表达水平的试剂、检测样本中所述生物标志物编码的多肽和/或蛋白表达水平的试剂。

6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述检测样本中生物标志物的mRNA表达水平的试剂包括特异性识别所述生物标志物的探针、特异性扩增所述生物标志物的引物;

优选地,所述检测样本中生物标志物编码的多肽和/或蛋白表达水平的试剂包括特异性结合所述生物标志物的配体、抗体、抗体片段、亲和性蛋白。

7.一种用于提高直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的药物组合物,其特征在于,所述药物组合物包括降低ABCC3表达水平的试剂、降低CTDP1表达水平的试剂、和/或降低CAPN12表达水平的试剂。

8.生物标志物在制备用于提高直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的药物组合物中的应用,其特征在于,所述生物标志物为ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12。

9.生物标志物ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12在构建预测直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的计算模型或者嵌入了所述计算模型的系统中的应用;

优选地,所述计算模型以生物标志物ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12的表达水平作为输入变量,通过生物信息学方法进行运算,输出直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性。

10.一种预测直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的系统,其特征在于,所述系统包括:

(1)评估装置:包括控制单元和存储单元,用于预测评估直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性;

(2)彼此通信连接的信息通信终端装置:用于提供关于来自直肠癌患者的样本中生物标志物ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12的表达水平的数据;

优选地,所述评估装置的控制单元包括如下四个单元:

1)数据接收单元:用于接收从所述信息通信终端设备传输的关于来自直肠癌患者的样本中生物标志物ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12表达水平的数据;

2)判别值计算单元:其基于对由所述数据接收单元接收的生物标志物ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12的表达水平以及存储在所述存储单元中的作为解释变量的生物标志物ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12的表达水平的判别来计算判别值;

3)判别值基准评价单元:其基于由所述判别值计算单元计算的判别值,对所述直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性进行评价;

4)评估结果发送单元:其将由所述判别值基准评估单元获得的所述直肠癌患者的预测评估结果发送到所述信息通信终端装置。

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