[发明专利]一种用于检测橡胶树胶孢炭疽菌的LAMP引物组及其检测方法和应用在审
申请号: | 202111138121.9 | 申请日: | 2021-09-27 |
公开(公告)号: | CN113684305A | 公开(公告)日: | 2021-11-23 |
发明(设计)人: | 梁晓宇;张宇;王萌;连文旭 | 申请(专利权)人: | 海南大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 海南盛亿专利代理事务所(普通合伙) 46005 | 代理人: | 吴燕梅 |
地址: | 570228 海*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 橡胶 树胶 炭疽 lamp 引物 及其 方法 应用 | ||
1.一种用于检测橡胶树胶孢炭疽菌的LAMP引物组,其特征在于,其包括外引物Tub-F3、外引物Tub-B3、内引物Tub-FIP和内引物Tub-BIP,其中,所述外引物Tub-F3的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述外引物Tub-B3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述内引物Tub-FIP的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述内引物Tub-BIP的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
2.一种用于检测橡胶树胶孢炭疽菌的试剂盒,包含权利要求1所述的LAMP引物组。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中含包括LAMP反应试剂。
4.根据权利要求1所述的LAMP引物组及权利要求2或3所述的试剂盒在检测橡胶树胶孢炭疽菌中的应用。
5.一种检测橡胶树胶孢炭疽菌的方法,其特征在于,它包括以下步骤:
S1.提取DNA:提取待检测橡胶树胶孢炭疽菌叶片的DNA;
S2.LAMP扩增:将步骤S1提取的DNA为模板,用权利要求1所述的引物组进行LAMP扩增;
S3.结果判定:扩增结束后加入SYBR Green I染液进行荧光染色,若反应管呈现绿色判定为阳性,若呈橙色判定为阴性;或者将反应产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,若凝胶电泳图为瀑布状梯形条带即为阳性,反之则为阴性。
6.根据权利要求5所述的一种检测橡胶树胶孢炭疽菌的方法,其特征在于,步骤S2所述LAMP扩增的反应体系为:0.18U·μL Bst-DNA polymerase,4mmol·L-1Mg2+,1mmol·L-1dNTPs,0.6mol·L-1甜菜碱,1.6μmol·L-1内引物FIP和BIP,0.2μmol·L-1内引物F3和B3,1μL DNA,1μL 10×Bst-DNA Polymerase Buffer,加ddH2O补足10μL。
7.根据权利要求5所述的一种检测橡胶树胶孢炭疽菌的方法,其特征在于,所述的LAMP扩增在62~64℃条件下进行,反应时间为50~90min。
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