[发明专利]一种宏基因组样本去宿主化的试剂盒及其应用在审

专利信息
申请号: 202111093817.4 申请日: 2021-09-17
公开(公告)号: CN115820800A 公开(公告)日: 2023-03-21
发明(设计)人: 罗伟伟;申奥;吴红龙 申请(专利权)人: 深圳华大因源医药科技有限公司;华大生物科技(武汉)有限公司;深圳华大基因股份有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12N15/10
代理公司: 上海弼兴律师事务所 31283 代理人: 王卫彬;吕学辰
地址: 518002 广东省深圳市前海深港合作*** 国省代码: 广东;44
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 宏基 样本 宿主 试剂盒 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种用于宏基因组样本去宿主化的试剂盒,其包含细胞处理剂、消化缓冲液以及DNA消化酶,其特征在于,所述细胞处理剂包含胰酶以及毛地黄皂苷,所述胰酶在所述细胞处理剂中的浓度为0.2~2g/mL,所述毛地黄皂苷在所述细胞处理剂中的浓度为1~2.5%,百分比的单位为g/mL。

2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述胰酶的浓度为1g/mL,所述毛地黄皂苷的浓度为2%。

3.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述消化缓冲液包含1.5~3M NaCl、80~160mM MgCl2、150~265mM Tris-HCl、50~75mM MnSO4、10~30mM DTT以及0.05~0.3%BSA;百分比单位为g/mL。

4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述消化缓冲液包含2.5M NaCl、125mMMgCl2、187.5mM Tris-HCl、62.5mM MnSO4、25mM DTT以及0.25%BSA;百分比为质量体积百分比,单位为g/mL。

5.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA消化酶包含浓度为250U/μL的全能核酸酶以及25U/μL的HL-SAN。

6.如权利要求1~5任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括样本前处理液;所述样本前处理液较佳地为DTT或PBS。

7.一种宏基因组样本去宿主化中宿主细胞裂解的方法,其特征在于,包括如下步骤:

步骤(1)将处理样本与权利要求1中所定义的细胞处理剂、消化缓冲液以及DNA消化酶混合;

步骤(2)混匀、孵育,离心后弃上清;

步骤(3)加入PBS,混匀后弃上清;

步骤(4)加入裂解混合液悬浮沉淀;

步骤(5)加入溶壁酶和蛋白酶K;

在步骤(1)所得混合体系中,胰酶的终浓度为0.2%,毛地黄皂苷的终浓度为0.01%;NaCl、MgCl2、Tris-HCl、MnSO4、DTT、BSA的终浓度分别为200mM、10mM、15mM、5mM、2mM、0.2%,全能核酸酶以及HL-SAN的终浓度分别为200U/mL和300U/mL;

以上百分比的单位为g/mL。

8.如权利要求7所述的方法,其特征在于,步骤(2)中所述混匀为震荡混匀。

9.如权利要求7或8所述的方法,其特征在于,步骤(2)中所述孵育为37℃温浴10min。

10.如权利要求1~6任一项所述的试剂盒在宏基因组去宿主化测序文库中的应用;所用样本选自痰液、肺泡灌洗液、脑脊液、组织以及胸腹水中的一种或多种。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳华大因源医药科技有限公司;华大生物科技(武汉)有限公司;深圳华大基因股份有限公司,未经深圳华大因源医药科技有限公司;华大生物科技(武汉)有限公司;深圳华大基因股份有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202111093817.4/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top