[发明专利]一种基因突变位点影响剪接可能性的评估处理方法在审
申请号: | 202111071348.6 | 申请日: | 2021-09-14 |
公开(公告)号: | CN113838522A | 公开(公告)日: | 2021-12-24 |
发明(设计)人: | 须周恒;刘静;梁萌萌 | 申请(专利权)人: | 浙江赛微思生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B20/50;G16B5/00;G16B40/00;G16B50/30 |
代理公司: | 南京九致知识产权代理事务所(普通合伙) 32307 | 代理人: | 齐棠 |
地址: | 314100 浙江省嘉兴市嘉善*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基因突变 影响 剪接 可能性 评估 处理 方法 | ||
1.一种基因突变位点影响剪接可能性的评估处理方法,其特征在于,包括以下步骤:
通过公共数据库,排除已报道的明确影响剪接的突变位点和不影响剪接的突变位点;同时,排除会明确导致功能丧失的突变位点;
将待测突变位点导入分析软件,获取突变位点剪接可能性数据;所述分析软件是指现有技术中能够分析突变位点剪接可能性的软件;
配置各分析软件对应的权重因子;
为分析软件配置权重因子,根据不同分析软件的权重因子和突变位点剪接可能性数据,建立评估模型,计算待测突变位点对应的建模可行性总得分,给出可行性判断;
对待测突变位点进行迷你基因实验,得到实验结果;
若所述的可行性判断与实验结果有偏差,则返回权重因子配置步骤,调整权重因子;直至所述的可行性判断与实验结果无偏差,则以该可行性判断评估待测突变位点的影响剪接可能性。
2.根据权利要求1所述的基因突变位点影响剪接可能性的评估处理方法,其特征在于,根据各分析软件对应的权重因子和突变位点剪接可能性的数据得分,得到加权和,所述加权和为所述突变位点的可行性总得分。
3.根据权利要求1所述的基因突变位点影响剪接可能性的评估处理方法,其特征在于,所述各分析软件的初始权重因子相同。
4.根据权利要求1所述的基因突变位点影响剪接可能性的评估处理方法,其特征在于,所述公共数据库为pubmed数据库。
5.根据权利要求1所述的基因突变位点影响剪接可能性的评估处理方法,其特征在于,所述会明确导致功能丧失的突变位点以突变类型和/或突变位置进行筛选。
6.根据权利要求5所述的基因突变位点影响剪接可能性的评估处理方法,其特征在于,所述会明确导致功能丧失的突变位点包括突变类型为片段缺失、无义突变或移码突变的突变位点。
7.根据权利要求1所述的基因突变位点影响剪接可能性的评估处理方法,其特征在于,所述分析软件包括Human Splicing Finder数据库、NetGene2数据库、NNSplice数据库、FSPLICE数据库和SpliceAI数据库。
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