[发明专利]一种铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒及其检测方法和应用在审

专利信息
申请号: 202111059583.1 申请日: 2021-09-10
公开(公告)号: CN113755589A 公开(公告)日: 2021-12-07
发明(设计)人: 孙悦;周虹桥;刘丹 申请(专利权)人: 上海普然生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12Q1/6844;C12N15/11
代理公司: 湖南乔熹知识产权代理事务所(普通合伙) 43262 代理人: 安曼
地址: 201600 上海市松*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 类药物 代谢 标志 基因 多态性 检测 试剂盒 及其 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述铂类代谢标志物包括ERCC1 T354C、ERCC1 C8092A、XRCC1 A1196G三个位点的基因多态性,试剂盒针对ERCC1 T354C、ERCC1 C8092A、XRCC1 A1196G的基因多态性设计特异性扩增引物和测序引物,所述试剂盒包括如下组分:样本处理液、磁珠、扩增试剂1、扩增试剂2、ERCC1 T354C、ERCC1 C8092A、XRCC1 A1196G测序引物和阳性对照。

2.根据权利要求1所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述ERCC1 T354C的特异性引物组序列如序列表SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:2所示;所述ERCC1 C8092A的特异性引物组序列如序列表SEQ ID NO:3~SEQ ID NO:4所示;所述XRCC1A1196G的特异性引物组序列如序列表SEQ ID NO:5~SEQ ID NO:6所示。

3.根据权利要求1所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述ERCC1 T354C测序引物、ERCC1 C8092A、XRCC1 A1196G测序引物分别如序列表SEQ IDNO:7~SEQ ID NO:9所示。

4.根据权利要求1所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,ERCC1 T354C、ERCC1 C8092A、XRCC1 A1196G共用一个分配指令如序列表SEQ ID NO:13所示。

5.根据权利要求1所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述样本处理液包括0.1%-0.6%十二烷基硫酸锂、0.1-0.5%曲拉通X-100、2-50mg/mL氢氧化钠、5-15%海藻糖、3~7mmol/L BSA、20-80mM Tris-HCl、100mM NaCl,PH=8.5-9.5。

6.根据权利要求1所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述磁珠为羧基磁珠,粒径为600mm。

7.根据权利要求1所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述扩增试剂1包括:扩增缓冲液,15mM醋酸镁。

8.根据权利要求1所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述扩增试剂2包括:ERCC1 T354C前引物0.32uM,ERCC1 T354C后引物0.32uM,ERCC1C8092A前引物0.32uM,ERCC1 C8092A后引物0.32uMdNTPS 0.3mM、XRCC1 A1196G前引物0.32uM,XRCC1 A1196G后引物0.32uM链置换DNA聚合酶1.2ng/μL,单链DNA结合蛋白3.2ng/μL,结合单链核酸的重组酶4.8ng/μL。

9.一种采用根据权利要求1~8任一项所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:

a.样本处理液100ul、4ul磁珠和30ulEDTA抗凝全血样本混合,室温静置5min;

b.将所述PCR扩增管放置在磁力架上,待磁珠全部吸附至一侧后从磁珠对侧将混合液吸出;

c.将配制好的PCR反应液加入到步骤b)得到的PCR扩增管中,使磁珠与所述PCR反应液充分混匀,离心,进行恒温反应;

d.将含微珠的结合液与扩增产物进行结合;

e.变性液处理得到单链产物;

f.加入洗涤缓冲液漂洗;

g.向每个测序管中加入测序酶和测序底物;

h.取一个8排管,自圆滑一端向平端依次加入dATP、dTTP、dGTP、dCTP、ERCC1T354C、ERCC1 C8092A、XRCC1 A1196G测序引物、ddGTP、ddCTP;

i.焦磷酸测序。

10.一种根据权利要求1~9任一项所述的铂类药物代谢标志物的基因多态性检测试剂盒及其检测方法的应用,其特征在于,所述检测试剂盒及其检测方法用于同时检测ERCC1T354C、ERCC1 C8092A、XRCC1 A1196G的基因多态性。

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