[发明专利]SNP标记组合、引物探针组合、试剂盒及其制备中的应用在审
申请号: | 202111029132.3 | 申请日: | 2021-09-03 |
公开(公告)号: | CN113462771A | 公开(公告)日: | 2021-10-01 |
发明(设计)人: | 毕宏生;蒋文君;赵海强;王兴荣;季鹏;郭滨;吴建峰 | 申请(专利权)人: | 山东中医药大学附属眼科医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11;G16B20/20;G16B40/00;G16H50/30 |
代理公司: | 北京君慧知识产权代理事务所(普通合伙) 11716 | 代理人: | 冯妙娜 |
地址: | 250002 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | snp 标记 组合 引物 探针 试剂盒 及其 制备 中的 应用 | ||
1.一种判定高度近视风险的SNP标记组合,其特征在于,所述SNP标记组合包括SNP1~SNP8共8个SNP位点,所述SNP1~SNP8位点如下所示:
SNP1位点的rs号为rs35771565,该SNP为C/T多态;
SNP2位点的rs号为rs2076486,该SNP为A/G多态;
SNP3位点的rs号为rs2301753,该SNP为G/T多态;
SNP4位点的rs号为rs3130573,该SNP为A/G多态;
SNP5位点的rs号为rs1065356,该SNP为G/A多态;
SNP6位点的rs号为rs3134605,该SNP为T/C多态;
SNP7位点的rs号为rs3131290,该SNP为G/A多态;
SNP8位点的rs号为rs2076523,该SNP为T/C多态。
2.用于检测权利要求1所述SNP标记组合的引物探针组合,其特征在于,所述引物探针组合包括下述引物探针组:
用于检测SNP1位点的引物探针组1,所述引物探针组由引物组1和探针P1组成,所述引物组1由引物F1和引物R1组成,所述引物F1为序列表的序列l所示的单链DNA分子;所述引物R1为序列表的序列2所示的单链DNA分子;所述探针P1为序列表的序列3所示的单链DNA分子;所述探针P1的5'端连接有荧光基团A1,3'端连接有淬灭基团B1;
用于检测SNP2位点的引物探针组2,所述引物探针组由引物组2和探针P2组成,所述引物组2由引物F2和引物R2组成,所述引物F2为序列表的序列4所示的单链DNA分子;所述引物R2为序列表的序列5所示的单链DNA分子;所述探针P2为序列表的序列6所示的单链DNA分子;所述探针P2的5'端连接有荧光基团A2,3'端连接有淬灭基团B2;
用于检测SNP3位点的引物探针组3,所述引物探针组由引物组3和探针P3组成,所述引物组3由引物F3和引物R3组成,所述引物F3为序列表的序列7所示的单链DNA分子;所述引物R3为序列表的序列8所示的单链DNA分子;所述探针P3为序列表的序列9所示的单链DNA分子;所述探针P3的5'端连接有荧光基团A3,3'端连接有淬灭基团B3;
用于检测SNP4位点的引物探针组4,所述引物探针组由引物组4和探针P4组成,所述引物组4由引物F4和引物R4组成,所述引物F4为序列表的序列l0所示的单链DNA分子;所述引物R4为序列表的序列11所示的单链DNA分子;所述探针P4为序列表的序列12所示的单链DNA分子;所述探针P4的5'端连接有荧光基团A4,3'端连接有淬灭基团B4;
用于检测SNP5位点的引物探针组5,所述引物探针组由引物组5和探针P5组成,所述引物组5由引物F5和引物R5组成,所述引物F5为序列表的序列13所示的单链DNA分子;所述引物R5为序列表的序列14所示的单链DNA分子;所述探针P5为序列表的序列15所示的单链DNA分子;所述探针P5的5'端连接有荧光基团A5,3'端连接有淬灭基团B5;
用于检测SNP6位点的引物探针组6,所述引物探针组由引物组6和探针P6组成,所述引物组6由引物F6和引物R6组成,所述引物F6为序列表的序列16所示的单链DNA分子;所述引物R6为序列表的序列17所示的单链DNA分子;所述探针P6为序列表的序列18所示的单链DNA分子;所述探针P6的5'端连接有荧光基团A6,3'端连接有淬灭基团B6;
用于检测SNP7位点的引物探针组7,所述引物探针组由引物组7和探针P7组成,所述引物组7由引物F7和引物R7组成,所述引物F7为序列表的序列19所示的单链DNA分子;所述引物R7为序列表的序列20所示的单链DNA分子;所述探针P7为序列表的序列21所示的单链DNA分子;所述探针P7的5'端连接有荧光基团A7,3'端连接有淬灭基团B7;和
用于检测SNP8位点的引物探针组8,所述引物探针组由引物组8和探针P8组成,所述引物组8由引物F8和引物R8组成,所述引物F8为序列表的序列22所示的单链DNA分子;所述引物R8为序列表的序列23所示的单链DNA分子;所述探针P8为序列表的序列24所示的单链DNA分子;所述探针P8的5'端连接有荧光基团A8,3'端连接有淬灭基团B8。
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