[发明专利]一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途

说明书

本发明涉及肿瘤分级检测领域，具体涉及一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途，所述的用于人肿瘤分级的基因组合由基因集A、基因片段集B和基因片段集C组成，所述用于人肿瘤分级的基因组合是从北京大学第一医院的实际尿路上皮癌病例的高通量测序数据中，通过特定的配对聚类分析得来，来源于真实的数据具有更高的可靠性和可信度，可以准确针对尿路上皮癌、泛癌进行恶性程度分级和预后预测。

技术领域

本发明涉及肿瘤分级检测领域，具体涉及一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途。

背景技术

尿路上皮癌是常见的泌尿系统恶性肿瘤，主要包括膀胱癌、肾盂癌、输尿管癌和尿道癌。近年来，尿路上皮癌的发病率逐年升高，其中最常见的为膀胱尿路上皮癌，其发病率在男性中位于所有恶性肿瘤的第四位，在女性中位于所有恶性肿瘤的第九位，且每年以2.5％左右的速度上升。尿路上皮癌最常见的症状为血尿，其主要治疗手段是以手术为基础的综合治疗。针对恶性程度较低、分期较早的膀胱尿路上皮癌，可以采用经尿道膀胱肿瘤电切术进行治疗，从而保留膀胱，患者生活质量较高；而针对恶性程度较高、分期较晚的膀胱尿路上皮癌则需要行根治性膀胱切除术+尿流改道术，虽然治疗了肿瘤，但患者的生活质量将明显下降。故针对尿路上皮癌，治疗中往往需要对肿瘤组织进行恶性程度分级以协助医生进行疾病诊断，确定治疗手段和方案，同时评估患者肿瘤复发和生存等预后情况。目前，WHO尿路上皮癌分级系统是应用最广泛的尿路上皮癌恶性程度分级系统。

WHO尿路上皮癌分级系统于1973年被提出，主要根据组织细胞核情况对该肿瘤的恶性程度及危险度进行分级评价。依据1973版WHO分级标准，将尿路上皮癌分为G1(高分化),G2(中分化),G3(低分化)三个层级，随着层级的增高，尿路上皮癌的恶性程度就越高，疾病治疗后出现复发、转移的风险也随之升高。2004年，WHO尿路上皮癌分级系统进行了更新，将尿路上皮癌分为低级别尿路上皮癌和高级别尿路上皮癌，其中，高级别尿路上皮癌具有更高的恶性程度，疾病治疗后出现复发、转移的风险也随之升高。然而，WHO尿路上皮癌分级系统是纯病理图像分型系统，存在如下缺陷：1、需要根据病理医生个人的经验进行判断，存在一定的主观性，不同病理医生之间差别巨大；2、实际操作中，1973版G2级(中分化)病理最终应判定为2004版中高级别或低级别尿路上皮癌在不同的病理医生间具有明显差别。以上的缺陷容易导致疾病的恶性程度分级不准确，对疾病进展和预后判断发生误差，影响疾病的诊疗。

随着二代测序技术的成熟和推广，利用基因检测来诊断疾病的方法受到了广泛的瞩目，如通过全外显子测序，检测标记物基因的突变及拷贝数变异情况，以此诊断肿瘤或判断肿瘤的进展。此方法克服了传统的肿瘤分级中存在的主观性影响和分级难度大的缺陷，对于肿瘤的早期诊断、治疗方式选择和预后判断均具有重大的意义。然而，现存基于二代测序技术且用于尿路上皮癌恶性程度分级的基因组合和方法，均缺乏外部验证，恶性程度分级不可靠，临床无法应用，因此，亟需找到一种基于特定基因检测的新型的肿瘤恶性程度及危险度分级系统对尿路上皮癌进行恶性程度分级。

发明内容

因此，本发明要解决的技术问题在于提供一种用于尿路上皮癌分级的基因组合及其用途，它能够对尿路上皮癌恶性程度进行分级并可用于尿路上皮癌患者的预后预测，为了实现这一目的，本发明使用全外显子测序技术，针对特殊筛选和分组的北京大学第一医院的尿路上皮癌患者数据进行筛选，最终得到本基因组合，用于尿路上皮癌的恶性程度分级和预后预测，为临床医生和患者提供了更为准确的尿路上皮癌恶性程度信息和疾病预测信息。

本发明提供了一种用于人肿瘤分级的基因组合，所述的基因组合由基因集A、基因片段集B和/或基因片段集C组成；

所述的基因集A包括：ACVR1B、ATP4B、AZGP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、CRYZL1、DCTN1、E2F3、EGFR、ERBB2、ERCC2、ESPL1、FGFR3、FKBP6、GZMM、H3-5、IGLL5、IRF7、METTL24、MORN5、MTOR、NPY1R、PET100、PIK3CA、PPARG、PTPN11、PTX4、RGPD8、SERPINA12、STAG2和ZNF141中至少一个；