[发明专利]一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途在审
| 申请号: | 202111028348.8 | 申请日: | 2021-09-02 |
| 公开(公告)号: | CN113604571A | 公开(公告)日: | 2021-11-05 |
| 发明(设计)人: | 熊耕砚;周利群 | 申请(专利权)人: | 北京大学第一医院 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 | 代理人: | 张均莹 |
| 地址: | 100034 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 肿瘤 分级 基因 组合 及其 用途 | ||
1.一种用于人肿瘤分级的基因组合,其特征在于,所述的基因组合由基因集A、基因片段集B和/或基因片段集C组成;
所述的基因集A包括:ACVR1B、ATP4B、AZGP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、CRYZL1、DCTN1、E2F3、EGFR、ERBB2、ERCC2、ESPL1、FGFR3、FKBP6、GZMM、H3-5、IGLL5、IRF7、METTL24、MORN5、MTOR、NPY1R、PET100、PIK3CA、PPARG、PTPN11、PTX4、RGPD8、SERPINA12、STAG2和ZNF141中至少一个;
所述的基因片段集B包括:chr1:155289001-155911999、chr1:226259001-226736999、chr8:30515001-30892999、chr8:42065001-43147999、chr9:134612001-135906999、chr11:48509001-55112999、chr14:24768001-105145999、chr16:1-73083999、chr18:1-319999和chr18:15325001-19749999中至少一个;
所述的基因片段集C包括:chr3:12030001-12639999、chr17:2293001-2306999和chr17:37830001-37979999中至少一个。
2.根据权利要求1所述的一种用于人肿瘤分级的基因组合,其特征在于,所述的基因片段集B中包括的详细基因如下表:
表1基因片段集B
3.根据权利要求1所述的一种用于人肿瘤分级的基因组合,其特征在于,所述的基因片段集C中包括的详细基因如下表:
表2基因片段集C
可选的,所述基因集A包括:ACVR1B、ATP4B、AZGP1、BRAF、CRYZL1、DCTN1、FKBP6、GZMM、H3-5、IGLL5、IRF7、METTL24、MORN5、NPY1R、PET100、PTPN11、PTX4、RGPD8、SERPINA12和ZNF141中至少一个;
所述基因片段集B包括:chr1:155289001-155911999、chr1:226259001-226736999、chr8:30515001-30892999、chr8:42065001-43147999、chr9:134612001-135906999、chr14:24768001-105145999、chr16:1-73083999、chr18:1-319999和chr18:15325001-19749999中至少一个;
所述基因片段集C包括:chr17:2293001-2306999。
4.权利要求1-3任一项所述的基因组合在制备用于人肿瘤分级检测的产品中的用途。
5.根据权利要求4所述的用途,其特征在于,所述的肿瘤为泌尿系统肿瘤或泛癌;
可选的,所述泌尿系统肿瘤为泌尿系统恶性肿瘤;
可选的,所述泌尿系统肿瘤为尿路上皮癌;
可选的,所述泛癌为TCGA泛癌数据中的癌种。
6.根据权利要求4或5所述的用途,其特征在于,所述的肿瘤分级是指肿瘤恶性程度判断和肿瘤预后的预测,用于指导临床诊疗;
可选的,所述肿瘤分级分为高风险组和低风险组。
7.根据权利要求4-6任一项所述的用途,其特征在于,所述产品包括用于检测所述基因组合中基因的基因类型的引物、探针、试剂、试剂盒、基因芯片或检测系统。
8.根据权利要求7所述的用途,其特征在于,所述产品为针对基因集A、基因片段集B和基因片段集C中基因的外显子和相关内含子区域进行检测。
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