[发明专利]一种微生物组学数据交互分析系统

说明书

本发明公开了一种微生物组学数据交互分析系统，属于微生物测定和检验领域。该系统包括用户界面模块、数据分析模块、数据库模块，和分析时间预测模块，其中，所述分析时间预测模块可以根据从用户界面模块获得的微生物组学数据信息、参考数据库类型信息和分析参数信息，预测分析所需时间，并发送至所述用户界面模块。利用本发明的系统，通过预先提供分析所需时间，可以让技术人员充分掌握获取分析结果的时间，从而第一时间将分析结果进行公布或应用，具有重要的科研和工业价值。

相关申请的交叉引用

本发明属于申请日为2020.12.02，申请号为202011389868.7，发明名称为“一种基于云平台的微生物组学数据交互分析系统”的中国发明专利申请的分案申请，其全部内容通过引用合并于此。

技术领域

本发明属于微生物测定和检验领域，具体地，涉及一种微生物组学数据交互分析系统。

背景技术

微生物组是指一个特定环境或者生态系统中全部微生物及其遗传信息，包括其细胞群体和数量、全部遗传物质(基因组)，它界定了涵盖微生物群及其全部遗传与生理功能，其内涵包括了微生物与其环境和宿主的相互作用。微生物组学是一个崭新的学科，微生物组研究取得的成果，必将为国家经济社会发展、人类生活质量改善提供源源不断的创新活力。

近十年中，超过17亿美元用于微生物组学大型研究计划包括：美国国家微生物组计划(NIH)、人体微生物组计划(HMP)、欧洲人体肠道宏基因组计划(MetaHIT)和中国科学院微生物组计划(CMI)。从各个计划的初步研究结果得知，微生物与人体的营养吸收、代谢调控、免疫系统发育及疾病产生的因果关系息息相关。而现今的微生物组学研究中微生物多样性于实验方面主要采取新一代高通量测序技术对微生物样本DNA进行抽提、扩增、混样、建库及测序，数据分析方面则是将测序数据进行质控、拼接、去冗余、聚类、物种注释、alpha多样性分析、beta多样性分析、物种群落分析、网络分析及功能预测等统计分析，整体具有较高技术难度且过程复杂，因此实际状况中，实验人员较难短时间配置分析服务器与熟悉分析流程。然而，生物信息分析则容易受限于本地服务器能力的限制，无法达到多任务并发的情况，因此建立提供分析平台是对于科研发展和临床应用均具有重要的意义。另一方面，目前在微生物组学分析过程中，技术人员往往无法稳定的预知掌握得到分析结果的时间，不能第一时间获得分析结果，从而耽误了后续分析的推进。同时，由于不能立即或在较短的时间内开展下一批次的分析，也会造成计算资源的严重浪费。

发明内容

为了解决上述技术问题的至少一个，本发明采用的技术方案如下：

本发明提供一种基于云平台的微生物组学数据交互分析系统，包括用户界面模块、数据分析模块、数据库模块和分析时间预测模块，其中，

所述用户界面模块用于获取用户输入信息，并将所述用户输入信息发送至所述数据分析模块，所述用户输入信息包括：用户信息、项目信息、微生物组学数据信息、参考数据库类型信息和分析参数信息；

所述数据分析模块，与所述用户界面模块连接，用于根据数据库类型信息和分析参数信息对所述微生物组学数据进行分析，并将分析中间过程和最终分析结果发送至用户界面模块；

所述数据库模块，与所述数据分析模块连接，用于存储或下载参考数据库；

所述分析时间预测模块，与所述用户界面模块连接，用于根据微生物组学数据信息、参考数据库类型信息和分析参数信息，预测分析所需时间，并发送至所述用户界面模块；

所述用户界面模块还用于显示所述预测分析所需时间以及所述分析中间过程和所述最终分析结果。进一步地，所述用户界面模块还可以在分析运行过程中，对数据库类型信息和/或分析参数信息进行可视化修改。更进一步地，用户通过用户界面模块，还可以完成上传、浏览、下载、锁定、复制、移动、重命名、删除，进行创建项目和项目共享的设定。

任选地，所述用户信息包括用户名称、创建时间信息等。