[发明专利]胃癌特异性LncRNA-GACAT3的检测装置在审

专利信息
申请号: 202110960232.1 申请日: 2021-08-20
公开(公告)号: CN113564256A 公开(公告)日: 2021-10-29
发明(设计)人: 蒋振;袁晓霞;谢杰斌;肖杨;罗瑶敏 申请(专利权)人: 川北医学院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6851
代理公司: 北京市领专知识产权代理有限公司 11590 代理人: 张玲
地址: 637000 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 胃癌 特异性 lncrna gacat3 检测 装置
【说明书】:

发明涉及胃癌特异性LncRNA‑GACAT3的检测装置,包括:数据库,用于存储GACAT3核酸序列码,所述数据库为Genebank数据库;PCR扩增平台,用于对GACAT3核酸序列码进行PCR扩增,从而得到扩增目的片段;重组质粒构建体系,用于将扩增目的片段进行载体连接后得到目标重组质粒,同时设置阴性对照质粒;筛查体系,用于对上述目标重组质粒和阴性对照质粒进行筛选,并对经酶切及测序鉴定合格后的重组质粒进行浓度计算,以检测LncRNA‑GACAT3的含量。本发明将LncRNA‑GACAT3重组质粒标准品定量成1×102~1×108copies/ul一共七个浓度梯度,采用荧光定量PCR扩增平台进行扩增,结果显示,对LncRNA‑GACAT3的含量最低检测限为81.322copies/ul。临床胃癌血清样本检测结果显示,对10例胃癌患者血清LncRNA‑GACAT3检测结果在1.56×102~3.98×104copies/ul之间。

技术领域

本发明涉及生物装置技术领域,特别涉及胃癌特异性LncRNA-GACAT3的检测装置。

背景技术

胃癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,胃癌的发病率及死亡率都很高,居我国肿瘤发病率的第二和第三。尤其早期诊断、治疗的手段有限,加之现有的胃癌肿瘤标志物的灵敏度和特异性均比较低,如常用的癌胚抗原(CEA)的灵敏度和特异度仅为68.6%和59.3%。因此,寻找理想的肿瘤标志物在胃癌的临床早期筛查中将具有重要的社会意义。

长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA分子,广泛存在于各种微生物中。lncRNA在细胞内可参与信号传导、转录激活、转录后修饰及蛋白质翻译调控等多种调控环节,在肿瘤细胞的病理生理过程中发挥着关键调控作用。长链非编码RNA-GACAT3全称为长链非编码RNA-胃癌相关转录本3(Gastric cancerassociated transcripts3,GACAT3)。前期通过基因芯片的方法检测出来长链非编码RNA-GACAT3在胃癌组织中具有高表达,可参见Ensemble数据库(ID为ENSG00000236289):

https://asia.ensembl.org/index.html

目前,有关于lncRNA-GACAT3在肝癌组织中的表达检测方法的报道,而对于其在胃癌组织中的表达存在检测效率低、特异性低、自动化程度低等问题。

所以,对胃癌组织中lncRNA-GACAT3的表达进行高效率、高特异性和高自动化的优化,对于胃癌的辅助诊断和预后监测具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于对胃癌组织中lncRNA-GACAT3的表达进行高效率、高特异性和高自动化的优化,提供一种胃癌特异性LncRNA-GACAT3的检测装置。

为了实现上述发明目的,本发明实施例提供了以下技术方案:

胃癌特异性LncRNA-GACAT3的检测装置,包括:

数据库,用于存储LncRNA-GACAT3核酸序列码,所述数据库为Genebank数据库;

PCR扩增平台,用于对LncRNA-GACAT3核酸序列码进行PCR扩增,从而得到目的扩增片段;

重组质粒构建体系,用于将目的扩增片段进行载体连接后得到重组质粒,并且设置阴性对照质粒;

鉴定体系,用于对所述重组质粒和阴性对照质粒进行筛选,并对经酶切鉴定及测序鉴定合格后的重组质粒进行浓度标准计算,以检测LncRNA-GACAT3的含量。

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