[发明专利]一种提高绵羊产羔数的SNP标记及方法

说明书

本发明公开一种影响绵羊产羔数的GPR54基因外显子区的SNP标记基因型的方法及其应用。该标记位于绵羊5号染色体的GPR54基因上，该基因第5外显子区域的核苷酸序列为SEQ ID NO：1，其中第514bp处的GG基因型绵羊的产羔数显著多于GT基因型和TT基因型个体，且GG为绵羊的优势基因型。本发明还公开了扩增SEQ ID NO：1序列所用的引物对及扩增方法。本发明以夷陵绵羊为研究对象，利用PCR扩增绵羊GPR54基因第5外显子区域的DNA序列变异，确定该变异位点的基因型并据此选留绵羊个体留种，分析该变异导致的氨基酸变化及GPR54基因特定位点基因型对绵羊产羔数的影响，可用于提高夷陵绵羊产羔数，为绵羊产羔数的标记辅助选择育种提供新的标记资源。

技术领域

本发明属于动物分子育种技术领域，涉及影响绵羊繁殖性状的SNP标记、检测方法及其在绵羊育种中的应用。

背景技术

产羔数是绵羊的一个重要经济性状，显著影响羊场的经济效益。湖羊是我国特有的绵羊品种，源于蒙古羊，经人为驯养选育，具有性成熟早、四季发情、高产羔率等繁殖特征。夷陵绵羊是以东弗利生羊、小尾寒羊和湖羊三品种杂交选育而成的绵羊群体，其突出特点是产多羔，因此研究影响夷陵绵羊产羔数的分子标记对于绵羊多胎资源的开发利用及生产实践有重要意义。

Kiss1/GPR54系统参与调控动物青春期和繁殖功能，在雌性动物的卵巢发育、胚胎附植、妊娠维持和雄性动物睾丸发育、精子发生等过程中发挥功能，Kiss1/GPR54的突变会影响性发育及性腺功能。

绵羊GPR54基因具有多态性。在高繁殖力绵羊品种(小尾寒羊和湖羊)和低繁殖力绵羊品种(中国美利奴羊和考利代羊)GPR54基因上游的5’端调控区-905碱基处检测到1个A/G核苷酸突变位点、-867bp至-863bp区域的一个5bp缺失/插入突变(TTCTT)，且该缺失/插入突变与小尾寒羊产羔数有关。湖羊GPR54基因第二外显子有2个多态位点T2360C、A2411C，分别引起氨基酸改变M90T、D107A。在梅赫拉班羊、沙尓羊以及两者与罗曼诺夫羊的杂交品种中，GPR54基因5’UTR区域、第四和第五外显子上存在多态位点，其中第四外显子突变C3431A与梅赫拉班羊产羔数和出生重呈负相关。本发明发现与绵羊产羔数性状相关的GPR54基因SNP标记，为绵羊产羔数性状的标记辅助选择提供新的标记资源。

发明内容

本发明旨在解决现有技术中对绵羊产羔数遗传选育所存在的技术问题之一。

本发明的第一个目的在于提供一种与绵羊产羔数性状相关、且能够有效用于夷陵绵羊产羔数选育的SNP标记及其应用。

根据本发明的实施例，所述SNP标记位于SEQ ID NO：1所示核苷酸序列的下划线标记处。

根据本发明的实施例，该SNP标记的GG基因型个体的产羔数显著高于GT基因型和TT基因型的个体。根据本发明的实施例，通过检测绵羊的上述SNP标记，能够有效地预测其产羔数，从而能够根据该SNP标记的基因型评估绵羊繁殖性能。因此本发明的SNP标记与绵羊的产羔数性状紧密相关，能够有效应用于绵羊的分子标记辅助育种，进而能够根据实际育种需求选择绵羊育种素材，从而能够准确、高效地挑选出产羔数多的优良个体，提高育种选择的效率和准确性。

本发明的第二个目的是提供一种用于检测权利要求1所述SNP标记的引物对。根据本发明的实施例，所述引物为具有SEQ ID NO：2和SEQIDNO：3所示的核苷酸序列，用于检测所述SNP标记。引物对的序列如下所示。

P1：GCCTTCGCTCTCTACAACCT(SEQ 1D NO：2)

P2：AGGGCAAGGCCTTTTCACTAT(SEQ ID NO：3)