[发明专利]一种2型糖尿病易感肠道菌的检测方法及试剂盒在审
| 申请号: | 202110898736.5 | 申请日: | 2021-08-05 | 
| 公开(公告)号: | CN113637780A | 公开(公告)日: | 2021-11-12 | 
| 发明(设计)人: | 方鹏宇;郭红辉 | 申请(专利权)人: | 广东君道营养科技有限公司 | 
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/145;C12R1/01 | 
| 代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 赵崇杨 | 
| 地址: | 510530 广东省广州市广州高新技术*** | 国省代码: | 广东;44 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 糖尿病 肠道 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测2型糖尿病易感肠道菌的多重qPCR引物和探针,其特征在于,包括用于检测多形拟杆菌、柔嫩梭菌、球形梭菌和毛螺菌的一对引物和四条探针;其中,用于同时检测多形拟杆菌、柔嫩梭菌、球形梭菌和毛螺菌的引物T2DM-F1/R1的序列依次如SEQ ID NO.1~2所示,用于检测多形拟杆菌的探针BT-P1的序列如SEQ ID NO.3所示,用于检测柔嫩梭菌的探针CL-P2的序列如SEQ ID NO.4所示,用于检测球形梭菌的探针CC-P1的序列如SEQ IDNO.5所示,用于检测毛螺菌的探针LB-P2的序列如SEQ ID NO.6所示,所述四条探针的5’端标记有不同的荧光发射基团,3’端标记有淬灭基团。
2.根据权利要求1所述引物和探针,其特征在于,SEQ ID NO.3所示探针的5’端荧光发射基团为FAM,SEQ ID NO.4所示探针的5’端荧光发射基团为VIC,SEQ ID NO.5所示探针的5’端荧光发射基团为Cy5,SEQ ID NO.6所示探针的5’端荧光发射基团为TEXAS RED,3’端淬灭基团均为BHQ1。
3.一种2型糖尿病易感肠道菌的检测方法,其特征在于,包含以下步骤:
S1.提取待测样本中的核酸;
S2.以步骤S1所得核酸为模板,用权利要求1所述引物和探针进行qPCR反应;
S3.反应结束后,通过探针序列上所携带的不同荧光通道曲线及Ct值判断结果,若出现扩增曲线且Ct值≤38,则代表对应菌的检测结果为阳性。
4.根据权利要求3所述方法,其特征在于,步骤S2所述qPCR反应的反应体系为:待检测核酸样本5μL,5×DNA PCR Buffer 5μL,40pmol/μL的T2DM-F1 0.25μL,40pmol/μL的T2DM-R1 0.25μL,20pmol/μL的BT-P1 0.15μL,20pmol/μL的CC-P1 0.5μL,20pmol/μL的CL-P2 0.5μL,20pmol/μL的LB-P2 0.25μL,酶系3μL,dNTPs 1μL,H2O 9.1μL。
5.根据权利要求3所述方法,其特征在于,步骤S2所述qPCR反应的反应程序为:50℃,2min,1个循环;95℃,15min,1个循环;94℃,15sec,55℃,45sec,40个循环。
6.根据权利要求4所述方法,其特征在于,所述酶系中含有热启动Taq酶和尿嘧啶DNA糖基化酶,所述dNTPs中还含有2'-脱氧尿苷-5'-三磷酸盐。
7.一种2型糖尿病易感肠道菌的检测试剂盒,其特征在于,含有权利要求1所述多重qPCR引物和探针,dNTPs以及qPCR反应所需酶试剂。
8.根据权利要求7所述试剂盒,其特征在于,所述酶试剂为热启动Taq酶。
9.根据权利要求7所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还含有尿嘧啶DNA糖基化酶和含2'-脱氧尿苷-5'-三磷酸盐的dNTPs。
10.根据权利要求7~9任一所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包含多形拟杆菌、柔嫩梭菌、球形梭菌以及毛螺菌目的基因的重组质粒作为阳性质控品,以及灭菌生理盐水作为阴性质控品。
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