[发明专利]一种显微成像扫描方法及扫描系统

说明书

本发明涉及一种显微成像扫描方法，该方法包括：获取预览图像、对应的二值化图像及图像中各个小块的边缘轮廓信息，并得到包含边缘轮廓信息的正外接矩形作为待扫描区域；针对当前待扫描区域，确定多个预聚焦视野，在各个预聚焦视野内采集多个显微图像，使用自动聚焦算法确定所述各个预聚焦视野的最佳聚焦位置并对其进行拟合，得到当前扫描区域中所有视野的最佳聚焦位置；根据所有视野的最佳聚焦位置和预设的扫描方式，扫描得到各预聚焦视野的清晰显微图像并进行拼接得到待扫描区域的显微图像；构建数字显微图像画布，将每个显微图像贴在数字显微图像画布对应的位置，得到全视野显微图像。采用本方法能够提高扫描的速度，节省数字图像存储空间。

技术领域

本申请涉及显微成像技术领域，特别是涉及一种显微成像扫描方法及扫描系统。

背景技术

现有的数字显微镜在扫描玻片样本时先拍摄一张玻片样本的预览图像，然后利用控制软件自动选定待扫描的样本区域，数字显微镜随后对选定的待扫描区域进行自动聚焦并扫描获得最终的高分辨率、全视野数字切片图像。

通常情况下，玻片样本上待检测的样本为一个细胞或者组织，集中在一个区域内，因而目前市面上大多数的数字显微镜都是单区域选定扫描，对一些特殊的玻片样本，由于扫描对象在切片上较为分散，如果还是按照常规的扫描方法，数字显微镜会将分散的多个细胞或者组织作为一个整体扫描到同一个区域内，扫描到同一区域的多个组织之间会留下许多空白区域，不但增加了扫描时间，也浪费了计算机的存储空间。

因此，亟需一种仅对检测到样本的区域进行扫描的方法，以提高扫描的速度，节省数字图像存储空间。

发明内容

基于此，有必要针对上述技术问题，提供一种能够提高扫描的速度，节省数字图像存储空间的一种显微成像扫描方法及扫描系统。

一种显微成像扫描方法，所述方法包括：

获取预览相机对玻片样本进行拍照得到的预览图像；以及获取所述预览图像对应的二值化图像；

获取所述二值化图像中各个小块的边缘轮廓信息，根据所述各个小块的边缘轮廓信息，得到包含所述各个小块边缘轮廓信息的多个正外接矩形，将所述多个正外接矩形作为多个待扫描区域；

选取所述多个待扫描区域中的一个待扫描区域作为当前待扫描区域，针对当前待扫描区域，选取多个预聚焦视野，在各个预聚焦视野内采集多个显微图像，对采集到的显微图像使用自动聚焦算法计算清晰度值，确定所述各个预聚焦视野的最佳聚焦位置；

对当前待扫描区域中各个预聚焦视野的最佳聚焦位置进行拟合，得到当前扫描区域中所有视野的最佳聚焦位置；

根据当前待扫描区域得到的所有视野的最佳聚焦位置和预设的扫描方式，扫描得到当前待扫描区域各个视野的清晰显微图像，将所述清晰显微图像进行拼接，得到当前待扫描区域的显微图像；

构建全分辨率数字显微图像画布，将每个待扫描区域的扫描显微图像贴在对应的位置，得到全视野显微图像。

优选的，所述针对当前待扫描区域，选取多个预聚焦视野，包括：利用预设的聚类算法对当前待扫描区域进行聚类，得到多个区域块；将各个区域块划分为N个子区域，计算各个子区域的饱和度，将饱和度大于预设值的子区域作为对应区域块的预聚焦视野。

所述计算各个子区域的饱和度，包括：将所述当前待扫描区域对应的预览图像从RGB颜色空间中提取饱和度分量；根据所述饱和度分量确定各个子区域的饱和度。