[发明专利]一种高通量单个免疫细胞表面受体核酸序列检测方法在审
| 申请号: | 202110855306.5 | 申请日: | 2021-07-28 |
| 公开(公告)号: | CN113528617A | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
| 发明(设计)人: | 訾晓渊;朱文奇 | 申请(专利权)人: | 新格元(南京)生物科技有限公司;南京通元医学检验实验室有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
| 代理公司: | 南京智造力知识产权代理有限公司 32382 | 代理人: | 朱旭;汪丽红 |
| 地址: | 210018 江苏省南京市江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 通量 单个 免疫 细胞 表面 受体 核酸 序列 检测 方法 | ||
1.一种高通量单个免疫细胞表面受体核酸序列检测方法,特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)将PBMC细胞悬液台盼蓝染色后加至微流控芯片,通过微孔分离单个细胞,使每个孔中得到一个细胞;
(2)将能够捕获RNA的磁珠注入微流控芯片中,使PBMC细胞和磁珠在同一个微孔中;
(3)向微流控芯片中注入细胞裂解液,使细胞裂解释放出RNA,释放出的RNA被磁珠捕获;
(4)捕获完成后,取出带有RNA的磁珠,用反转录试剂进行反转录,合成CDNA第一链;
(5)反转录完成后的产物进行PCR富集TCR/BCR。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中所述PBMC悬液的细胞浓度为1~2×105 cells/mL,细胞活性大于85%。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中所述微流控芯片的微孔数为1000~50000个。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中所述同一个微孔为每个微孔中同时含有一个PBMC细胞和一个能捕获RNA引物的条形码的磁珠。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述细胞裂解液的组成成分中含有1 M ~2M Tris-Hcl 5μL,0.5 M~1M Licl 10 μL,10%~15%Triton 0.5μL,5~10mM EDTA2μL,5mM DTT 5μL,Dnase/Rnase-Free Water 72.5μL,dNTP mix 5μL。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的细胞裂解液的组成成分为:每100 μL的细胞裂解液中含有2M Tris-Hcl 5μL,0.5M Licl 10 μL,10%Triton 0.5μL,10mM EDTA2μL,5mM DTT 5μL,Dnase/Rnase-Free Water 72.5μL,dNTP mix 5μL。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)中所述的反转录为在芯片中加入一定量的RT-Master mix体系,FC-40氟化液油封后将芯片放置于烘箱中。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述烘箱的温度为40~45℃,时间为2~3h。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述的RT-Master mix体系中,每100 μL的RT-Master mix体系包含有2 x Master mix 50μL、DTT 10μL、Oligo dT 2.5μL、RTInibitor 2.5μL、Enzymatic RT酶 10μL、Dnase/Rnase-Free Water 25μL。
10.一种细胞裂解液,其特征在于,每100 μL所述的细胞裂解液中含有1 M ~2M Tris-Hcl 5μL,0.5 M~1M Licl 10 μL,10%~15%Triton 0.5μL,5~10mM EDTA 2μL,5mM DTT 5μL,Dnase/Rnase-Free Water 72.5μL,dNTP mix 5μL。
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