[发明专利]一种基于MB-LAMP检测鲣鱼的试剂盒及方法在审
申请号: | 202110855135.6 | 申请日: | 2021-07-28 |
公开(公告)号: | CN113444809A | 公开(公告)日: | 2021-09-28 |
发明(设计)人: | 熊雄;许文杰;操敏;熊晓辉 | 申请(专利权)人: | 南京工业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6844 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 王艳 |
地址: | 211816 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 mb lamp 检测 鲣鱼 试剂盒 方法 | ||
1.一种基于MB-LAMP检测鲣鱼的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括一组外引物对、一组内引物对、一个环引物和一个分子信标探针,所述外引物对为引物F3和引物B3,所述内引物对为引物BIP和引物FIP,所述环引物为引物LB,所述的分子信标探针为LFP,其序列如下所示:
F3:CCATTCCTACATACTTCAAAAC;
B3:CATCCGAGGATTTTGTTCTCT;
BIP:CCTACATTATCATCGCCCAAGTTTTTCTGCAAGTGGGAAGAAGATG;
FIP:CCGATTCAGGTAAGGATTGCCTTTTCACTTACATTCCGACCAGTC;
LB:GTCCGTCCTTTATTTCTCGTT;
LFP:FAM-AGCGGCTGCAATGAGGGTCCGCT-Dabcyl。
2.根据权利要求1所述的基于MB-LAMP检测鲣鱼的试剂盒,其特征在于,所述分子信标探针LFP全长23bp,所述分子信标探针LFP包括中环状区域和茎干区,所述中环状区域来自环引物LF前13个碱基CTGCAATGAGGGT,在环引物LF的5’端修饰荧光基团FAM,3’端修饰猝灭基团Dabcyl,所述环引物LF的序列如下:CTGCAATGAGGGTTCAAAATAA。
3.根据权利要求1所述的基于MB-LAMP检测鲣鱼的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阳性对照和阴性对照。
4.根据权利要求1所述的基于MB-LAMP检测鲣鱼的试剂盒,其特征在于,所述引物F3、引物B3、引物BIP、引物FIP、引物LB、分子信标探针LFP的体积比为1:1:4:4:2:4。
5.一种基于MB-LAMP检测鲣鱼的方法,其特征在于,以待检测的物种基因组DNA为模板,利用权利要求1-4任一项所述的试剂盒进行环介导等温扩增反应,根据有无“S”型扩增曲线判断阴阳性结果,有“S”型扩增曲线为阳性结果,反之为阴性结果。
6.根据权利要求4所述的基于MB-LAMP检测鲣鱼的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待检测物种基因组DNA;
(2)引物F3、引物B3、引物FIP、引物BIP、引物LB、分子信标探针LFP的设计,所述引物F3、引物B3、引物BIP、引物FIP、引物LB、分子信标探针LFP序列分别为:
F3:CCATTCCTACATACTTCAAAAC;
B3:CATCCGAGGATTTTGTTCTCT;
BIP:CCTACATTATCATCGCCCAAGTTTTTCTGCAAGTGGGAAGAAGATG;
FIP:CCGATTCAGGTAAGGATTGCCTTTTCACTTACATTCCGACCAGTC;
LB:GTCCGTCCTTTATTTCTCGTT;
LFP:FAM-AGCGGCTGCAATGAGGGTCCGCT-Dabcyl;
(3)在含有步骤(1)的待检测物种基因组DNA、步骤(2)的引物F3、引物B3、引物FIP、引物BIP、引物LB、分子信标探针LFP的LAMP反应体系内进行扩增,每分钟收集一次荧光信号进行实时荧光检测;
(4)根据有无“S”型扩增曲线判断阴阳性结果,有“S”型扩增曲线为阳性结果,反之为阴性结果。
7.根据权利要求6所述的基于MB-LAMP检测鲣鱼的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述扩增反应的反应体系为25μL的体系时,反应体系为2×Lamp Master Mix 12.5μL、10μM的引物F30.5μL、10μM的引物B30.5μL、10μM的引物FIP 2μL、10μM的引物BIP 2μL、10μM的引物LB1μL、10μM的分子信标探针LFP 1μL、8U/μL的DNAPolymerase 0.5μL、50ng模板DNA,其余为无菌水。
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