[发明专利]一种多方法联用的大片段DNA重组方法在审

专利信息
申请号: 202110848701.0 申请日: 2021-07-26
公开(公告)号: CN113584065A 公开(公告)日: 2021-11-02
发明(设计)人: 王康;苏翠 申请(专利权)人: 赛业(苏州)生物科技有限公司
主分类号: C12N15/64 分类号: C12N15/64
代理公司: 苏州市方略专利代理事务所(普通合伙) 32267 代理人: 石磊
地址: 215400 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 多方 联用 片段 dna 重组 方法
【权利要求书】:

1.一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,包括以下步骤:

确认好需要进行拼接修饰的BAC,根据需要将BAC修饰好重组酶位点,再通过RMCE进行拼接,拼接完成的BAC进行下一步的拼接;当三个BAC拼接好后再通过phes负筛将不需要的重组酶位点删去,最终得到无缝拼接的BAC。

2.根据权利要求1所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

(1)根据片段需要在BAC上设计抗性片段和重组酶位点;

(2)引物设计;

(3)进行BAC修饰:

(4)RMCE-BAC融合;

(5)Phes负筛进行无缝修饰;

(6)最终BAC提取以及验证。

3.根据权利要求2所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述步骤(1)包括以下具体步骤:

1)根据项目需要查找BAC大片段需要拼接的位置;

2)根据确定的位置然后选择插入的重组酶位点;

3)确定好重组酶位点后根据拼接需要确认插入抗性序列;

4)通过RMCE进行融合拼接,将完整的序列拼接出来;

5)通过Phes删除残留的重组酶位点。

4.据权利要求3所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述重组酶位点选自loxP=SEQ ID NO:1、lox511=SEQ ID NO:2、lox5171=SEQ ID NO:3、lox2272=SEQ ID NO:4、LoxN=SEQ ID NO:5中的一个或者多个;所述抗性序列选自Kan抗性序列=SEQ ID NO:6、Amp抗性序列=SEQ ID NO:7、Spe抗性序列=SEQ ID NO:8;Zeo-phes序列=SEQ ID NO:9中的一个或者多个。

5.根据权利要求2所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述步骤(2)引物设计包括以下具体步骤:

1)根据拼接好的文件将引物设计出来;

2)引物设计时需要参照引物设计规则,并且引物需要带有overlap;

3)引物设计规则如下

结合长度Tm值GC含量特异性
20-25bp45-6040%-60%无明显错配

6.根据权利要求2所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述步骤(3)进行BAC修饰具体包括以下步骤:

1)通过设计好的引物进行PCR,扩增获得需要的模块;

2)通过Red修饰的方法进行修饰重组酶位点以及筛选抗性;

3)通过菌落PCR确认是否修饰完成;

4)将修饰好的BAC安排BAC提取。

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