[发明专利]一种多方法联用的大片段DNA重组方法在审
申请号: | 202110848701.0 | 申请日: | 2021-07-26 |
公开(公告)号: | CN113584065A | 公开(公告)日: | 2021-11-02 |
发明(设计)人: | 王康;苏翠 | 申请(专利权)人: | 赛业(苏州)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/64 | 分类号: | C12N15/64 |
代理公司: | 苏州市方略专利代理事务所(普通合伙) 32267 | 代理人: | 石磊 |
地址: | 215400 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多方 联用 片段 dna 重组 方法 | ||
1.一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,包括以下步骤:
确认好需要进行拼接修饰的BAC,根据需要将BAC修饰好重组酶位点,再通过RMCE进行拼接,拼接完成的BAC进行下一步的拼接;当三个BAC拼接好后再通过phes负筛将不需要的重组酶位点删去,最终得到无缝拼接的BAC。
2.根据权利要求1所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
(1)根据片段需要在BAC上设计抗性片段和重组酶位点;
(2)引物设计;
(3)进行BAC修饰:
(4)RMCE-BAC融合;
(5)Phes负筛进行无缝修饰;
(6)最终BAC提取以及验证。
3.根据权利要求2所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述步骤(1)包括以下具体步骤:
1)根据项目需要查找BAC大片段需要拼接的位置;
2)根据确定的位置然后选择插入的重组酶位点;
3)确定好重组酶位点后根据拼接需要确认插入抗性序列;
4)通过RMCE进行融合拼接,将完整的序列拼接出来;
5)通过Phes删除残留的重组酶位点。
4.据权利要求3所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述重组酶位点选自loxP=SEQ ID NO:1、lox511=SEQ ID NO:2、lox5171=SEQ ID NO:3、lox2272=SEQ ID NO:4、LoxN=SEQ ID NO:5中的一个或者多个;所述抗性序列选自Kan抗性序列=SEQ ID NO:6、Amp抗性序列=SEQ ID NO:7、Spe抗性序列=SEQ ID NO:8;Zeo-phes序列=SEQ ID NO:9中的一个或者多个。
5.根据权利要求2所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述步骤(2)引物设计包括以下具体步骤:
1)根据拼接好的文件将引物设计出来;
2)引物设计时需要参照引物设计规则,并且引物需要带有overlap;
3)引物设计规则如下
结合长度 Tm值 GC含量 特异性 20-25bp 45-60 40%-60% 无明显错配
。
6.根据权利要求2所述的一种多方法联用的大片段DNA重组方法,其特征在于,所述步骤(3)进行BAC修饰具体包括以下步骤:
1)通过设计好的引物进行PCR,扩增获得需要的模块;
2)通过Red修饰的方法进行修饰重组酶位点以及筛选抗性;
3)通过菌落PCR确认是否修饰完成;
4)将修饰好的BAC安排BAC提取。
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