[发明专利]一种基于PCR扩增和CRISPR-Cas12a的核酸检测方法及应用有效
| 申请号: | 202110839859.1 | 申请日: | 2021-07-23 |
| 公开(公告)号: | CN113388691B | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
| 发明(设计)人: | 李振军;邱小彤;徐帅 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12R1/365 |
| 代理公司: | 北京市众天律师事务所 11478 | 代理人: | 李新军 |
| 地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 pcr 扩增 crispr cas12a 核酸 检测 方法 应用 | ||
1.一种基于非诊断目的应用CRISPR-Cas12a技术检测核酸的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤
(1)以样本中的核酸作为模板进行聚合酶链扩增反应,其中,所述聚合酶链扩增反应上游引物的序列如SEQ ID NO. 2所示,所述聚合酶链扩增反应的下游引物的序列如SEQ IDNO. 3所示,所述聚合酶链扩增反应使用的上游引物的5’端加入了PAM位点的修饰,所述PAM位点修饰的序列如SEQ ID NO. 1所示;
(2)使用步骤(1)获取的聚合酶链扩增产物,Cas12a蛋白、荧光基团和荧光淬灭基团双标记的单链DNA探针,以及crRNA分子在CRISPR-Cas12a技术检测体系里反应,所述单链DNA探针的序列如SEQ ID NO.5所示,所述crRNA分子的序列如SEQ ID NO.4;
(3)对步骤(2)的反应体系进行荧光强度的检测。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述聚合酶链扩增反应的退火温度为61-73℃。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述聚合酶链扩增反应的退火温度为69℃。
4.一种基于CRISPR-Cas12a技术的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括crRNA分子,Cas12a蛋白、荧光基团和荧光淬灭基团双标记的单链DNA探针,以及用于聚合酶链扩增反应的上游引物,用于聚合酶链扩增反应的下游引物,其中,所述聚合酶链扩增反应的上游引物的序列由SEQ ID NO. 2所示,所述聚合酶链扩增反应的下游引物的序列由SEQID NO. 3所示,所述crRNA分子的序列如SEQ ID NO. 4所示,所述DNA探针的序列如SEQ IDNO. 5所示,在所述上游引物的5’端加入了PAM位点的修饰,所述的PAM位点的修饰序列如SEQ ID NO. 1所示。
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