[发明专利]一组基因组合理简约化的伯克氏菌突变株与底盘菌株及其构建方法和应用在审
申请号: | 202110820845.5 | 申请日: | 2021-07-20 |
公开(公告)号: | CN113583900A | 公开(公告)日: | 2021-11-02 |
发明(设计)人: | 卞小莹;刘嘉琪;张友明 | 申请(专利权)人: | 山东大学 |
主分类号: | C12N1/20 | 分类号: | C12N1/20;C12N15/74;C12N15/31;C07K14/195;C12R1/01 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 李健康 |
地址: | 266237 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 基因组 合理 简约 伯克氏菌 突变 底盘 菌株 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一组基因组合理简约化的伯克氏菌(Schlegelella brevitalea)DSM 7029突变株,其特征在于:所述突变株是以野生型伯克氏菌DSM 7029为出发菌,删除其基因组Tn1区域、Tn2区域、Tn34区域、Tn5-GI3区域、Tn6-GI1区域、Prophage 1区域、Prophage2-GI7区域和生物合成基因簇5制得的基因组简约化的伯克氏菌DSM 7029ΔTn1ΔTn2ΔTn34ΔTn5-GI3ΔTn6-GI1ΔProphage1ΔProphage2-GI7ΔBGC5突变株,命名为DT8,该突变株删除了4.7%的基因组非必需区域;其中所述Tn1区域为46,274bp,是GenBank:CP011371.1,399,555-445,828bp;所述Tn2区域为30,979bp,是GenBank:CP011371.1,1,869,872-1,900,850bp;所述Tn34区域为64,539bp,是GenBank:CP011371.1,4,789,725-4,854,263bp;所述Tn5-GI3区域为27,328bp,是GenBank:CP011371.1,5,111,402-5,138,729bp;所述Tn6-GI1区域为36,134bp,是GenBank:CP011371.1,6,161,822-6,197,955bp;所述Prophage 1区域为24,197bp,是GenBank:CP011371.1,2,396,164-2,420,360bp;所述Prophage2-GI7区域为59,887bp,是GenBank:CP011371.1,4,682,041-4,741,927bp;所述生物合成基因簇5为BGC5,17.308bp,是GenBank:CP011371.1,2,677,295-2,694,602bp;或是以DT8基因组简约化突变株为出发菌,继续删除其生物合成基因簇6制得的基因组简约化的伯克氏菌DSM 7029ΔTn1ΔTn2ΔTn34ΔTn5-GI3ΔTn6-GI1ΔProphage1ΔPropha ge2-GI7ΔBGC5ΔBGC6突变株,命名为DT9,该突变株删除了4.8%的基因组非必需区域;其中所述生物合成基因簇6为BGC6,3,373bp,是GenBank:CP011371.1,3,093,895-3,097,267bp;或是以DT9基因组简约化突变株为出发菌,继续删除其生物合成基因簇7制得的基因组简约化的伯克氏菌DSM 7029ΔTn1ΔTn2ΔTn34ΔTn5-GI3ΔTn6-GI1ΔProphage1ΔProphage2-GI7ΔBGC5ΔBGC6ΔBGC7突变株,命名为DT10,该突变株删除了4.9%的基因组非必需区域;其中所述生物合成基因簇7为BGC7,7,588bp,是GenBank:CP011371.1,3,195,049-3,202,636bp。
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