[发明专利]一种珊瑚礁区长棘海星幼虫分子监测方法有效
申请号: | 202110813599.0 | 申请日: | 2021-07-19 |
公开(公告)号: | CN113337621B | 公开(公告)日: | 2022-11-22 |
发明(设计)人: | 罗鹏;李卓波;夏淑蓉;马波;胡超群;任春华 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星;朱聪聪 |
地址: | 511458 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 珊瑚礁 区长 海星 幼虫 分子 监测 方法 | ||
1.一种珊瑚礁区长棘海星幼虫分子监测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)标准参照长棘海星幼虫DNA模板制作;2)珊瑚礁区浮游动物样品的过滤收集;3)珊瑚礁区收集浮游动物样品DNA的提取;4)浮游动物样品PCR扩增及检测,PCR检测中采用了鉴别长棘海星幼虫的检测引物,如果在785bp处有目的条带为长棘海星幼虫阳性,如果没有则阴性;
所述的鉴别长棘海星幼虫的检测引物,包括:正向引物:AcanP-TF:GCACGATTTGTCTCTGCCAA;反向引物:AcanP-TR: AGTCCTTCTCTCGCCAGGT;
所述的珊瑚礁区浮游动物样品的过滤收集是采用浅水2型浮游生物网进行珊瑚礁区海水中浮游动物样品的采集,样品采集深度为0.5-10m,过滤水体后,从外部冲洗,将浮游动物浓缩于网的底部,收集海水,得到样品海水;将100μm/50mm规格的尼龙滤膜用镊子,装入滤器当中,采用注射器抽取样品海水,过滤于滤膜上,过滤完后,取出滤膜,表面喷淋一层95%的酒精到湿润既可,放到采样管或离心管中保存;
所述的DNA的提取是用无菌镊子取出附着有浮游动物样品的滤膜,用吹风机的冷风吹干滤膜,采用无菌剪刀将滤膜剪碎,连同滤膜一起采用细菌基因组DNA提取试剂盒提取滤膜上生物样品的DNA,采用10mM Tris-Cl缓冲液洗脱,保存,得到DNA;
所述的PCR,其PCR体系是25μL反应体系,包括:DNA模板0.5μL, AcanP-TF/TR各0.5μL,ddH20 11μL, 2× Premix rTaq 12.5μL;
所述的PCR,其PCR反应程序是94℃ 4min;94℃ 20sec, 62℃ 30sec, 72℃ 1min, 32cycles; 72℃ 5min。
2.根据权利要求1所述的珊瑚礁区长棘海星幼虫分子监测方法,其特征在于,标准参照长棘海星幼虫DNA阳性模板设有多个梯度,根据海水样品与标准参照目的条带的亮度,检测采集点的长棘海星幼虫密度。
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