[发明专利]TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用在审

专利信息
申请号: 202110805008.5 申请日: 2021-07-16
公开(公告)号: CN113637751A 公开(公告)日: 2021-11-12
发明(设计)人: 李扬秋;陈存特;陈政;黄玲;周玲玲;朱丽花;刘思初;曾成武;李文瑜 申请(专利权)人: 暨南大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/686;C12Q1/6869;C12N15/113
代理公司: 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 代理人: 苏运贞
地址: 510632 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: tnfaip3 编码 序列 突变 检测 试剂 制备 预测 细胞 淋巴瘤 预后 试剂盒 中的 应用
【权利要求书】:

1.TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用。

2.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,其特征在于:通过检测临床患者的外周血中TNFAIP3非编码序列突变情况,从而预测T细胞淋巴瘤预后。

3.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,其特征在于:

所述的突变的区域为如下区域的至少一个区域或多个区域的组合:

1)TNFAIP3基因5′-UTR的部分或全部区域;

2)TNFAIP3基因3′-UTR的部分或全部区域;

3)TNFAIP3基因内含子的部分或全部区域。

4.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,其特征在于:

所述的突变的区域为TNFAIP3基因如下六个位点的至少一个位点或多个位点的组合:g.3918、g.3637、g.3869、g.13751、g.14244、g.11822。

5.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,其特征在于:所述的预测具体指:

①当TNFAIP3非编码序列有突变时,T细胞淋巴瘤患者临床预后良好的可能性较大;

②当TNFAIP3非编码序列无突变时,T细胞淋巴瘤患者临床预后差的可能性较大。

6.一种预测T细胞淋巴瘤预后的试剂盒,其特征在于:包括如下用于扩增TNFAIP3基因5′-UTR启动子序列片段的引物、用于扩增TNFAIP3基因3′-UTR序列片段的引物和用于扩增TNFAIP3基因外显子和内含子序列片段的引物中的一组或多组引物的组合:

(1)用于扩增TNFAIP3基因5′-UTR启动子序列片段的引物:

Promoter(g.2933-3687)(F):5'-TTTACAAAGGAGCACCAGCAGGAGA-3';

Promoter(g.2933-3687)(R):5'-ATTACATTTAAGAATACTTGTCAGG-3';

Promoter(g.3568-4249)(F):5'-AAGTGCCACCCTCCATCC-3';

Promoter(g.3568-4249)(R):5'-AGCGGTGACAGCCTTTGG-3';

Promoter(g.4110-4744)(F):5'-GGTGAGTGTTGTTCTGATTC-3';

Promoter(g.4110-4744)(R):5'-TCACGTGACTCTCTGGGTCG-3';

(2)用于扩增TNFAIP3基因3′-UTR序列片段的引物:

3’-UTR(g.18828-19347)(F):5'-CAACGGCTACTGCAACGAAT-3';

3’-UTR(g.18828-19347)(R):5'-CTCGCTGCCATGAGGATCT-3';

3’-UTR(g.19272-19787)(F):5'-GAGAAGCCAGAGCCATTCCACCT-3';

3’-UTR(g.19272-19787)(R):5'-GCTCATGCCCCAACAACAACCA-3';

3’-UTR(g.19717-20407)(F):5'-GCTGCCCTAGAAGTACAATA-3';

3’-UTR(g.19717-20407)(R):5'-GACAGCAACCACAAAGCACAC-3';

3’-UTR(g.20455-20938)(F):5'-CCCAGAGATAAAGGCTGCCAT-3';

3’-UTR(g.20455-20938)(R):5'-GGAAGCACAGTCTTAATATC-3';

(3)用于扩增TNFAIP3基因外显子和内含子序列片段的引物:

Exon2(F):5'-GGAGTCGTATTAAAGTCAGGCTAA-3';

Exon2(R):5'-GGCAAAAGAAACACAACAGAAC-3';

Exon3(F):5'-TTGCTGGGTCTTACATGCAG-3';

Exon3(R):5'-CCCACCATGGAGCTCTGTTA-3';

Exon4(F):5'-GGGAGTACAGGATACATTCAAGC-3';

Exon4(R):5'-GCTGAAAGCATTTAAGTACAGATCC-3';

Exon5(F):5'-ACCTAAGGGCCTCATTTTCC-3';

Exon5(R):5'-AGCAAAAAGGAAAACCCTGA-3';

Exon6(F):5'-TGAGATCTACTTACCTATGGCCTTG-3';

Exon6(R):5'-CAGATGACACAGGAGAGAGCTG-3';

Part1 of exon 7(F):5'-GGTTCTACAATTCTTGCCATAATCC-3';

Part1 of exon 7(R):5'-CAAGTGCCTTGTGTGGTCTG-3';

Part2 of exon 7(F):5'-CACAACGGATTTTGTGAACG-3';

Part2 of exon 7(R):5'-AGGAACAAAACCCCTTCTGG-3';

Exon8(F):5'-CTCTGTATCGGTGGGGTGAC-3';

Exon8(R):5'-CAAAAAGCATCGAACACACG-3';

Exon9(F):5'-TGATCTGCCTGTTCTTTCCA-3';

Exon9(R):5'-GGGTTCAGAGGATAGCACCA-3'。

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