[发明专利]TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用在审
申请号: | 202110805008.5 | 申请日: | 2021-07-16 |
公开(公告)号: | CN113637751A | 公开(公告)日: | 2021-11-12 |
发明(设计)人: | 李扬秋;陈存特;陈政;黄玲;周玲玲;朱丽花;刘思初;曾成武;李文瑜 | 申请(专利权)人: | 暨南大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12Q1/6869;C12N15/113 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 苏运贞 |
地址: | 510632 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | tnfaip3 编码 序列 突变 检测 试剂 制备 预测 细胞 淋巴瘤 预后 试剂盒 中的 应用 | ||
1.TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用。
2.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,其特征在于:通过检测临床患者的外周血中TNFAIP3非编码序列突变情况,从而预测T细胞淋巴瘤预后。
3.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,其特征在于:
所述的突变的区域为如下区域的至少一个区域或多个区域的组合:
1)TNFAIP3基因5′-UTR的部分或全部区域;
2)TNFAIP3基因3′-UTR的部分或全部区域;
3)TNFAIP3基因内含子的部分或全部区域。
4.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,其特征在于:
所述的突变的区域为TNFAIP3基因如下六个位点的至少一个位点或多个位点的组合:g.3918、g.3637、g.3869、g.13751、g.14244、g.11822。
5.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,其特征在于:所述的预测具体指:
①当TNFAIP3非编码序列有突变时,T细胞淋巴瘤患者临床预后良好的可能性较大;
②当TNFAIP3非编码序列无突变时,T细胞淋巴瘤患者临床预后差的可能性较大。
6.一种预测T细胞淋巴瘤预后的试剂盒,其特征在于:包括如下用于扩增TNFAIP3基因5′-UTR启动子序列片段的引物、用于扩增TNFAIP3基因3′-UTR序列片段的引物和用于扩增TNFAIP3基因外显子和内含子序列片段的引物中的一组或多组引物的组合:
(1)用于扩增TNFAIP3基因5′-UTR启动子序列片段的引物:
Promoter(g.2933-3687)(F):5'-TTTACAAAGGAGCACCAGCAGGAGA-3';
Promoter(g.2933-3687)(R):5'-ATTACATTTAAGAATACTTGTCAGG-3';
Promoter(g.3568-4249)(F):5'-AAGTGCCACCCTCCATCC-3';
Promoter(g.3568-4249)(R):5'-AGCGGTGACAGCCTTTGG-3';
Promoter(g.4110-4744)(F):5'-GGTGAGTGTTGTTCTGATTC-3';
Promoter(g.4110-4744)(R):5'-TCACGTGACTCTCTGGGTCG-3';
(2)用于扩增TNFAIP3基因3′-UTR序列片段的引物:
3’-UTR(g.18828-19347)(F):5'-CAACGGCTACTGCAACGAAT-3';
3’-UTR(g.18828-19347)(R):5'-CTCGCTGCCATGAGGATCT-3';
3’-UTR(g.19272-19787)(F):5'-GAGAAGCCAGAGCCATTCCACCT-3';
3’-UTR(g.19272-19787)(R):5'-GCTCATGCCCCAACAACAACCA-3';
3’-UTR(g.19717-20407)(F):5'-GCTGCCCTAGAAGTACAATA-3';
3’-UTR(g.19717-20407)(R):5'-GACAGCAACCACAAAGCACAC-3';
3’-UTR(g.20455-20938)(F):5'-CCCAGAGATAAAGGCTGCCAT-3';
3’-UTR(g.20455-20938)(R):5'-GGAAGCACAGTCTTAATATC-3';
(3)用于扩增TNFAIP3基因外显子和内含子序列片段的引物:
Exon2(F):5'-GGAGTCGTATTAAAGTCAGGCTAA-3';
Exon2(R):5'-GGCAAAAGAAACACAACAGAAC-3';
Exon3(F):5'-TTGCTGGGTCTTACATGCAG-3';
Exon3(R):5'-CCCACCATGGAGCTCTGTTA-3';
Exon4(F):5'-GGGAGTACAGGATACATTCAAGC-3';
Exon4(R):5'-GCTGAAAGCATTTAAGTACAGATCC-3';
Exon5(F):5'-ACCTAAGGGCCTCATTTTCC-3';
Exon5(R):5'-AGCAAAAAGGAAAACCCTGA-3';
Exon6(F):5'-TGAGATCTACTTACCTATGGCCTTG-3';
Exon6(R):5'-CAGATGACACAGGAGAGAGCTG-3';
Part1 of exon 7(F):5'-GGTTCTACAATTCTTGCCATAATCC-3';
Part1 of exon 7(R):5'-CAAGTGCCTTGTGTGGTCTG-3';
Part2 of exon 7(F):5'-CACAACGGATTTTGTGAACG-3';
Part2 of exon 7(R):5'-AGGAACAAAACCCCTTCTGG-3';
Exon8(F):5'-CTCTGTATCGGTGGGGTGAC-3';
Exon8(R):5'-CAAAAAGCATCGAACACACG-3';
Exon9(F):5'-TGATCTGCCTGTTCTTTCCA-3';
Exon9(R):5'-GGGTTCAGAGGATAGCACCA-3'。
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