[发明专利]一组检测核酸的DNAzyme探针及其应用有效
| 申请号: | 202110799522.2 | 申请日: | 2021-07-15 |
| 公开(公告)号: | CN113528511B | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
| 发明(设计)人: | 陈俊;黄婷;陈金香;谢宝平;段文军 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/682 |
| 代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 齐键 |
| 地址: | 510515 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一组 检测 核酸 dnazyme 探针 及其 应用 | ||
1.一组检测核酸的DNAzyme探针,包含:酶链H1、底物链H2、酶链H3和底物链H4;
所述酶链H1从5’到3’依次包括:A序列、B序列、C序列、D序列和E序列;
所述E序列与目标核酸互补;
所述D序列为TAG、AAG、ATG、TTG或GCG;
所述C序列为ATAGTGGG、AAAGTGGG、ATAGTGGG、TTAGTGGG或GCAGTGGG;
所述B序列为基于DNAzyme探针对应金属离子的DNAzyme催化活性中心;
所述A序列与E序列5’端的第2~18位碱基互补;
所述底物链H2从5’到3’依次包括:F序列、G序列、H序列、I序列和J序列;
所述F序列为ACCAGCCGCAAAT(SEQ ID NO.13)或ATAGGGTCATGCT(SEQ ID NO.14);
所述G序列与所述C序列互补;
所述H序列为两个核糖核苷酸;
所述I序列与所述A序列的3’端互补配对;
所述J序列与所述F序列及G序列的第一位碱基连接而成的序列互补;
所述底物链H2的5’端和3’端分别标记有荧光基团和荧光淬灭基团;
所述酶链H3从5’到3’依次包括:K序列、B序列、L序列、M序列和N序列;
所述N序列与所述F序列与所述G序列连接而成的序列互补;
所述M序列为TTTAT;
所述L序列与目标核酸的3’端互补;
所述K序列与所述M序列3’端的第1位碱基与所述N序列5’端的第1~16位碱基连接而成的序列互补;
所述底物链H4从5’到3’依次包括:O序列、H序列、P序列和Q序列;
所述O序列与所述E序列互补;
所述P序列与所述K序列的3’端互补;
所述Q序列与所述目标核酸的5’端的第1~17位碱基互补;
所述底物链H4的5’端和3’端分别标记有荧光基团和荧光淬灭基团;
所述金属离子为锌离子、锰离子和铜离子中的至少一种。
2.根据权利要求1所述的检测核酸的DNAzyme探针,其特征在于:
所述核酸为miR-373,所述金属离子为锌离子时,所述酶链H1的序列为GCTTCGATTTTGGGGTGTCCGAGCCGGTCGAAATAGTGGGTAGACACCCCAAAATCGAAGCACTTC(SEQ ID NO.1);
所述底物链H2的序列为ACCAGCCGCAAATCCCACTAT/rA//rG/CACCCCAAGATTTGCGGCTGGT(SEQ ID NO.2);
所述酶链H3的序列为CCGCAAATCCCACTATATCCGAGCCGGTCGAAACACCCCAATTTATATAGTGGGATTTGCGGCTGGT(SEQ ID NO.3);
所述底物链H4的序列为GAAGTGCTTCGATTTTGGGGTGT/rA//rG/TATAGTGGCAAAATCGAAGCACTTC(SEQ ID NO.4)。
3.一种检测核酸的纳米颗粒,包含:
权利要求1~2中任一项所述的DNAzyme探针;和
金属有机框架材料;
所述金属有机框架材料中的金属离子为DNAzyme探针对应金属离子。
4.根据权利要求3所述的纳米颗粒,其特征在于:
所述金属有机框架材料为ZIF-8、ZIF-90、ZPF-2、Mn-TCPP、Cu-TCPP和NU-110(Cu)中的至少一种。
5.一种检测核酸的纳米颗粒的制备方法,其特征在于:
将权利要求1~2中任一项所述的DNAzyme探针和有机配体混合,加入可溶性金属盐,得到纳米颗粒;
所述有机配体为硝基咪唑、醛基咪唑、氨基咪唑、2-甲基咪唑、四羧基苯卟啉和苯三甲酸盐中的至少一种;
所述可溶性金属盐为醋酸锌、硝酸锌、氯化锰和硝酸铜中的至少一种。
6.一种试剂盒,包含:权利要求1~2中任一项所述的DNAzyme探针和/或权利要求3~4中任一项所述的纳米颗粒。
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