[发明专利]一种浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记及其应用有效
申请号: | 202110797903.7 | 申请日: | 2021-07-15 |
公开(公告)号: | CN113278728B | 公开(公告)日: | 2021-10-15 |
发明(设计)人: | 姜鹏;刘文政;刘倩纯;赵瑾 | 申请(专利权)人: | 中国科学院海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 李颖 |
地址: | 266071 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 漂浮 生态型 叶绿体 基因组 特异 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记扩增引物,其特征在于:浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记扩增引物为:
上游引物:5’-ACCAACAAATACCCCATTCTTTGA-3’
下游引物:5’-TTTCTCTCCATACCCCCATCG-3’。
2.按权利要求1所述的浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记扩增引物的应用,其特征在于:所述引物扩增浒苔漂浮生态型floating ecotype叶绿体基因组特异分子标记,扩增标记在用于对黄海浒苔绿潮的早期预警、过程跟踪监测,以及浒苔漂浮生态型向其他生境的扩散入侵监测中的应用。
3.一种浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记的应用,其特征在于:浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记用于黄海浒苔绿潮的早期预警、过程跟踪监测或向其他生境的扩散入侵监测,对鉴定浒苔漂浮生态型占比的应用;
所述浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记为SEQ ID NO.1中碱基序列所示。
4.一种鉴定漂浮生态型浒苔的检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含权利要求1所述的引物。
5.一种鉴定漂浮生态型浒苔的方法,其特征在于:
以权利要求1所述的浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记特异引物,对浒苔中提取的总DNA进行PCR扩增;
以浒苔漂浮生态型的基因组为模板、引物对进行扩增,扩增获得一条966 bp的特异性条带,特征性条带即为SEQ ID NO.1中所示的浒苔漂浮生态型叶绿体基因组特异分子标记,扩增结果为样品阳性;
未扩增出特异性条带,扩增结果为样品阴性。
6.根据权利要求5所述的鉴定漂浮生态型浒苔的方法,其特征在于: PCR扩增体系为:25μl,含9.5μl ddH2O,12.5μl 2×Taq Master Mix,0.5μl 正向引物10μM,0.5μl 反向引物10 μM,2.0μl 模板 DNA 30 ng/μl;
PCR扩增程序为:94℃×10 min;94℃×45 s、52.5℃×45 s、72℃×1 min,35个循环;72℃×10 min;4℃保存。
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