[发明专利]一种植物双靶点CRISPR/Cas9载体及其构建方法和应用有效
申请号: | 202110770783.1 | 申请日: | 2021-07-07 |
公开(公告)号: | CN113388635B | 公开(公告)日: | 2022-08-19 |
发明(设计)人: | 熊兴鹏;程文翰;胡玉婷;高莹莹;余小林 | 申请(专利权)人: | 荆楚理工学院 |
主分类号: | C12N15/82 | 分类号: | C12N15/82;C12N15/113;C12N9/22;C12N15/55;C12N15/66 |
代理公司: | 深圳智趣知识产权代理事务所(普通合伙) 44486 | 代理人: | 崔艳峥 |
地址: | 448000 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 植物 双靶点 crispr cas9 载体 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种植物双靶点CRISPR/Cas9载体的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1:克隆sgRNA表达框,所述sgRNA表达框依次连接有启动子和sgRNA支架,通过同源重组的方法把所述sgRNA表达框插入psgR-Cas9-At骨架载体,所述psgR-Cas9-At骨架载体上依次连接有启动子、sgRNA支架、Cas9表达框,所述启动子为U6-26或U3,所述U6-26的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述U3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述sgRNA支架的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述Cas9表达框的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,此步得到串联两个所述sgRNA表达框的中间载体;
S2:通过酶切连接的方法把所述sgRNA表达框和所述Cas9表达框插入pBI121骨架载体,得到pBI121-Cas9;
S3:把步骤S2产物中所述sgRNA表达框中的Bpi I酶切位点改造成多克隆位点,得到pBI121-MCS-Cas9,所述MCS为多克隆位点;
S4:根据靶基因的DNA序列,设计2条sgRNA序列,分别为sgRNA1和sgRNA2,根据酶切位点的侧翼序列在所述sgRNA序列上加上接头作为PCR引物,所述PCR引物以步骤S1获得的所述中间载体为模板进行PCR扩增;
S5:通过同源重组的方法把步骤S4的PCR产物连入步骤S3的所述pBI121-MCS-Cas9中,获得所述植物双靶点CRISPR/Cas9载体。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S1中克隆sgRNA表达框使用的2对引物为:
2*U6-26-HR-F1:ACGACGGCCAGTGCCCATTCGGAGTTTTTGTATCTTGTTTC;
2*U6-26-HR-R1:CAAAAACTCCGAATGAAAAAAGCACCGACTCGGTG;
2*U6-26-HR-F2:CCGAGTCGGTGCTTTTTTCATTCGGAGTTTTTGTATCTTGTTTC;
2*U6-26-HR-R2:CAATTTGTGAAATATAAAAAAGCACCGACTCGGTG;
所述psgR-Cas9-At骨架载体使用Sma I进行单酶切线性化。
3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S2中分别用Hind III和EcoRI双酶切所述psgR-Cas9-At骨架载体和所述pBI121骨架载体,酶切产物分别电泳后切胶回收,再用T4 DNA连接酶连接,得到所述pBI121-Cas9。
4.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S3中设计两对引物,以所述psgR-Cas9-At骨架载体为模板,分别克隆所述U6-26启动子和所述sgRNA支架;Hind III和Sma I双酶切所述pBI121-Cas9骨架载体,所述U6-26启动子和所述sgRNA支架以及双酶切后的pBI121-Cas9骨架载体同源重组,得到所述pBI121-MCS-Cas9;
步骤S3中使用的2对引物为:
Bpi-MCS-121HR-F1:CATGATTACGCCCATTCGGAGTTTTTGTATCTTGTTTC;
Bpi-MCS-MR1:CTAAAACAAGCTTGTCGACCTCGAGCAATCACTACTTCGA
CTCTAGCTGTATATAA;
Bpi-MCS-MF2:GTGATTGCTCGAGGTCGACAAGCTTGTTTTAGAGCTAGAA
ATAGCAAGTTAAAATA;
Bpi-MCS-121HR-R2:CAATTTGTGAAATATAAAAAAGCACCGACTCGGTG。
5.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S3中所述多克隆位点为XhoI-Sal I-Hind III。
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