[发明专利]一种植物双靶点CRISPR/Cas9载体及其构建方法和应用有效

专利信息
申请号: 202110770783.1 申请日: 2021-07-07
公开(公告)号: CN113388635B 公开(公告)日: 2022-08-19
发明(设计)人: 熊兴鹏;程文翰;胡玉婷;高莹莹;余小林 申请(专利权)人: 荆楚理工学院
主分类号: C12N15/82 分类号: C12N15/82;C12N15/113;C12N9/22;C12N15/55;C12N15/66
代理公司: 深圳智趣知识产权代理事务所(普通合伙) 44486 代理人: 崔艳峥
地址: 448000 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一种 植物 双靶点 crispr cas9 载体 及其 构建 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种植物双靶点CRISPR/Cas9载体的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:

S1:克隆sgRNA表达框,所述sgRNA表达框依次连接有启动子和sgRNA支架,通过同源重组的方法把所述sgRNA表达框插入psgR-Cas9-At骨架载体,所述psgR-Cas9-At骨架载体上依次连接有启动子、sgRNA支架、Cas9表达框,所述启动子为U6-26或U3,所述U6-26的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述U3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述sgRNA支架的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述Cas9表达框的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,此步得到串联两个所述sgRNA表达框的中间载体;

S2:通过酶切连接的方法把所述sgRNA表达框和所述Cas9表达框插入pBI121骨架载体,得到pBI121-Cas9;

S3:把步骤S2产物中所述sgRNA表达框中的Bpi I酶切位点改造成多克隆位点,得到pBI121-MCS-Cas9,所述MCS为多克隆位点;

S4:根据靶基因的DNA序列,设计2条sgRNA序列,分别为sgRNA1和sgRNA2,根据酶切位点的侧翼序列在所述sgRNA序列上加上接头作为PCR引物,所述PCR引物以步骤S1获得的所述中间载体为模板进行PCR扩增;

S5:通过同源重组的方法把步骤S4的PCR产物连入步骤S3的所述pBI121-MCS-Cas9中,获得所述植物双靶点CRISPR/Cas9载体。

2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S1中克隆sgRNA表达框使用的2对引物为:

2*U6-26-HR-F1:ACGACGGCCAGTGCCCATTCGGAGTTTTTGTATCTTGTTTC;

2*U6-26-HR-R1:CAAAAACTCCGAATGAAAAAAGCACCGACTCGGTG;

2*U6-26-HR-F2:CCGAGTCGGTGCTTTTTTCATTCGGAGTTTTTGTATCTTGTTTC;

2*U6-26-HR-R2:CAATTTGTGAAATATAAAAAAGCACCGACTCGGTG;

所述psgR-Cas9-At骨架载体使用Sma I进行单酶切线性化。

3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S2中分别用Hind III和EcoRI双酶切所述psgR-Cas9-At骨架载体和所述pBI121骨架载体,酶切产物分别电泳后切胶回收,再用T4 DNA连接酶连接,得到所述pBI121-Cas9。

4.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S3中设计两对引物,以所述psgR-Cas9-At骨架载体为模板,分别克隆所述U6-26启动子和所述sgRNA支架;Hind III和Sma I双酶切所述pBI121-Cas9骨架载体,所述U6-26启动子和所述sgRNA支架以及双酶切后的pBI121-Cas9骨架载体同源重组,得到所述pBI121-MCS-Cas9;

步骤S3中使用的2对引物为:

Bpi-MCS-121HR-F1:CATGATTACGCCCATTCGGAGTTTTTGTATCTTGTTTC;

Bpi-MCS-MR1:CTAAAACAAGCTTGTCGACCTCGAGCAATCACTACTTCGA

CTCTAGCTGTATATAA;

Bpi-MCS-MF2:GTGATTGCTCGAGGTCGACAAGCTTGTTTTAGAGCTAGAA

ATAGCAAGTTAAAATA;

Bpi-MCS-121HR-R2:CAATTTGTGAAATATAAAAAAGCACCGACTCGGTG。

5.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S3中所述多克隆位点为XhoI-Sal I-Hind III。

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