[发明专利]RNA中m5 在审
| 申请号: | 202110767395.8 | 申请日: | 2021-07-07 |
| 公开(公告)号: | CN113740401A | 公开(公告)日: | 2021-12-03 |
| 发明(设计)人: | 郑峻松;朱全敬;李艳;方立超;李承红;邓均;黄辉;刘华敏;汪莉娜;刘飞雪 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军陆军军医大学 |
| 主分类号: | G01N27/416 | 分类号: | G01N27/416;G01N27/327;G01N27/30;C12Q1/682;C12Q1/6825 |
| 代理公司: | 重庆金橙专利代理事务所(普通合伙) 50273 | 代理人: | 唐健玲 |
| 地址: | 400000 重*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | rna base sup | ||
1.一种用于肿瘤早期预警检测的双重分析的逻辑光电化学传感器,其特征在于,所述用于肿瘤早期预警检测的双重分析的逻辑光电化学传感器包括:
不同浓度的m5C靶序列与10-7M m6A靶序列共同孵育后的DNA步行器1,用于在同一根电极表面检测光电信号;
当不同浓度的m6A靶序列与10-7M m5C靶序列共同孵育后的DNA步行器2,用于在同一根电极表面检测光电信号。
2.如权利要求1所述的用于肿瘤早期预警检测的双重分析的逻辑光电化学传感器,其特征在于,所述DNA步行器1,用于在同一根电极表面检测的465nm波长下的光电信号;
所述DNA步行器2,用于在同一根电极表面检测的625nm波长下的光电信号。
3.一种利用权利要求1~2任意一项所述用于肿瘤早期预警检测的双重分析的.逻辑光电化学传感器的RNA中m5C和m6A双重分析的逻辑光电化学传感方法,其特征在于,所述RNA中m5C和m6A双重分析的逻辑光电化学传感方法包括以下步骤:
步骤一,构建H型纳米支架;
步骤二,进行DNA步行器的构建;
步骤三,进行DNA折纸的构建;
步骤四,进行电极表面修饰和光电信号检测。
4.如权利要求3所述RNA中m5C和m6A双重分析的逻辑光电化学传感方法,其特征在于,步骤一中,所述构建H型纳米支架,包括:
用四条寡核苷酸序列构建H型纳米支架;
配置TM杂交缓冲液,用该缓冲液稀释A、B、A1、B1,等比杂交使终浓度为2μM,快速退火得到H型结构,并用15%的聚丙烯酰胺凝胶电泳在150V的电压下验证是否正确形成;其中,所述TM杂交缓冲液由10mM tris-盐酸、1mM EDTA以及12.5mM氯化镁组成;
所述退火,包括:
于90℃10min,迅速退火到4℃持续0.5h以上,取出放入4℃储存备用;
所述A的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述B的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,所述A1的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述B1的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
5.如权利要求3所述RNA中m5C和m6A双重分析的逻辑光电化学传感方法,其特征在于,步骤二中,所述DNA步行器的构建,包括:
用链霉亲和素标记的Fe3O4磁珠作为支撑基体构建DNA步行器,生物素标记L1和S1链,将S1和outputA在37℃杂交2h形成双链结构;
用结合缓冲液清洗磁珠三次,将磁珠重悬于结合缓冲液中,将L1和S1/outputA按照一定比例加入一定量的磁珠中,37℃振荡混合40min,使磁珠与L1和S1充分反应结合,并用TM缓冲液清洗备用;L2、S2和磁珠的连接体的制备方法同理。
6.如权利要求5所述RNA中m5C和m6A双重分析的逻辑光电化学传感方法,其特征在于,所述L1的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,所述S1的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示,所述outputA的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示,所述L2的核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示,所述S2的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示。
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