[发明专利]一种动物源性成分检测方法及其应用在审
申请号: | 202110745205.2 | 申请日: | 2021-07-01 |
公开(公告)号: | CN113493826A | 公开(公告)日: | 2021-10-12 |
发明(设计)人: | 甘永琦;朱斌;樊兰艳;谭慧敏 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区食品药品检验所 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 南宁市来来专利代理事务所(普通合伙) 45118 | 代理人: | 来光业 |
地址: | 530021 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 动物 成分 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种动物源性成分检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
(1)构建数据库;
(2)样品DNA提取;
(3)Cytb基因序列扩增;
(4)MiSeq测序及测序分析;
所述步骤(1)构建数据库的方法如下:
a1. 收集物种完整的Cytb基因fasta序列;
b1. 将这些序列及对应的taxonomy信息整合成fasta格式的文件,然后转换成数据库dat格式;
c1. 在MiSeq Reporter Metagenomics中设置并导入数据库;所述数据库包含186个属,476个种的动物Cytb基因序列信息;
所述步骤(3)Cytb基因序列扩增方法如下:
a2. 设计引物Cytb-F和Cytb-R扩增各样品的短片段序列;其中,
引物Cytb-F: 5’-CCATCCAACATCTCAGCATGATGAAA-3’
引物Cytb-R: 5’-GCCCCTCAGAATGATATTTGTCCTCA-3’
b2. PCR反应体系为20μL,其中Premix Taq 12.5μL、正反向引物10μM各0.5μL、模板DNA1μL、超纯水5.5μL,PCR反应程序先后采用降落PCR{95℃,3min;3循环(95℃,30s;62℃,30s;72℃,10s);3循环(95℃,30s;60℃,30s;72℃,10s);3循环(95℃,30s;58℃,30s;72℃,10s);26循环(95℃,30s;55℃,30s;72℃,10s);3循环(95℃,30 s;53℃,30s;72℃,10s)72℃,7min},得到PCR产物;
c2. 将得到的PCR产物进行1%的琼脂糖凝胶电泳,目的片段大小为100 ~350bp,用AMPure XP beads纯化各样品PCR产物。
2.根据权利要求1所述的动物源性成分检测方法,其特征在于:所述步骤(2)样品DNA提取的方法为:将肉类样品匀浆粉碎,称取1mg样品用基因组DNA提取试剂盒提取样品总DNA。
3.根据权利要求1所述的动物源性成分检测方法,其特征在于:所述步骤(4)MiSeq测序及测序分析步骤为:
a3. 在扩增引物的5’端加入接头和测序用引物序列,再通过有限循环PCR加入Illumina测序接头和标签序列以区分不同样品;
b3. 用Nextera XT Index Kit进行PCR扩增加入测序标记,PCR反应体系为50μL,包括Premix Taq 25μL、Nextera XT Index正反向引物各5μL,模板DNA5μL、超纯水10μL,PCR 反应条件为95℃3min;8循环(95℃,30s;55℃,30s;72℃,30s);72℃5min,得到样品PCR产物;
c3. 用AMPure XP beads纯化各样品PCR产物,通过Qubit® Fluorometer对PCR产物定量分析,并统一稀释成4nM,将各样品以及PhiX Control一同构成测序样品文库,变性处理后,采用MiSeq Reagent Kit v2 (500-cycles)试剂盒上机测序;
d3. 测序结束后,通过MiSeq Reporter Metagenomics分析得到样品成分及组分结果。
4.根据权利要求1所述的动物源性成分检测方法,其特征在于:所述的引物Cytb-F和引物Cytb-R的序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。
5.根据权利要求1~3任一项所述的动物源性成分检测方法在肉制品掺假、掺杂检验中的应用。
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