[发明专利]基于RAA扩增和CRISPR-Cas13a系统的SARS-CoV-2核酸检测方法有效
| 申请号: | 202110723406.2 | 申请日: | 2021-06-28 |
| 公开(公告)号: | CN113549618B | 公开(公告)日: | 2023-08-18 |
| 发明(设计)人: | 刘鸿博;宋宏彬;邱少富;王立贵;杜昕颖;向莹;杨明娟;杨超杰;刘洪波;王辉;王琪 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军疾病预防控制中心 |
| 主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/10;C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12N15/63 |
| 代理公司: | 北京市众天律师事务所 11478 | 代理人: | 李新军 |
| 地址: | 100071*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 raa 扩增 crispr cas13a 系统 sars cov 核酸 检测 方法 | ||
1. 一种用于CRISPR-Cas13a技术检测SARS-CoV-2核酸的crRNA分子,所述crRNA分子的序列如SEQ ID NO.11所示。
2. 一种应用权利要求1所述crRNA分子基于非诊断目的的CRISPR-Cas13a技术检测SARS-CoV-2 核酸的方法,所述方法包括以下步骤:
(1)制备样本核酸模板;
(2)使步骤(1)获取的核酸模板,Cas13a蛋白、荧光基团和荧光淬灭基团双标记的RNA探针,以及所述crRNA分子在CRISPR-Cas13a反应体系里反应,所述crRNA分子的序列如SEQ IDNO.11所示;
(3)对步骤(2)的反应体系进行荧光强度的检测。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述的样本核酸模板由重组酶聚合酶核酸扩增方法制备。
4. 根据权利要求3所述的方法,其特征在于, 所述重组酶聚合酶核酸扩增的上游引物的序列如SEQ ID NO. 27所示,所述重组酶聚合酶核酸扩增的下游引物的序列如SEQ IDNO.29所示。
5. 根据权利要求2-4任一所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述RNA探针的序列如SEQID NO.13所示。
6. 一种CRISPR-Cas13a技术检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的crRNA分子 ,Cas13a蛋白、荧光基团和荧光淬灭基团双标记的RNA探针,以及用于重组酶聚合酶核酸扩增的上游引物,用于重组酶聚合酶核酸扩增的下游引物,所述crRNA分子的序列如SEQ ID NO.11所示,所述重组酶聚合酶核酸扩增的上游引物的序列如SEQ ID NO. 27所示,所述重组酶聚合酶核酸扩增的下游引物的序列如SEQ ID NO.29所示。
7. 根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述RNA探针的序列如SEQ ID NO.13所示。
8. 一种用于制备权利要求1所述crRNA的上游DNA单链和下游DNA单链,其特征在于,所述上游DNA单链的序列如SEQ ID NO. 33所示,所述下游DNA单链的序列如SEQ ID NO.12所示。
9. 一种用于制备权利要求1所述crRNA的方法,其特征在于,先使序列如SEQ ID NO.33所示的上游DNA单链和序列如SEQ ID NO.12所示的下游DNA单链进行杂交制备DNA体外转录模板,再根据所述DNA体外转录模板转录制备所述crRNA。
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