[发明专利]一种检测GII型诺如病毒的巢式PCR引物及其应用在审
| 申请号: | 202110719279.9 | 申请日: | 2021-06-28 |
| 公开(公告)号: | CN113308578A | 公开(公告)日: | 2021-08-27 |
| 发明(设计)人: | 王永杰;喻勇新;贾添慧;董蕾 | 申请(专利权)人: | 上海海洋大学 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6848;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 上海唯智赢专利代理事务所(普通合伙) 31293 | 代理人: | 吴瑾瑜 |
| 地址: | 201306 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 gii 型诺如 病毒 pcr 引物 及其 应用 | ||
1.一种检测GII型诺如病毒的巢式PCR引物,其特征在于,上游引物和下游引物分别含有如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述检测GII型诺如病毒的巢式PCR引物,其特征在于,上游引物和下游引物核苷酸序列分别如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示。
3.一种检测GII型诺如病毒的RT-PCR引物,其特征在于,上游引物和下游引物分别含有如SEQ ID No.3和SEQ ID No.2所示核苷酸序列。
4.根据权利要求3所述检测GII型诺如病毒的RT-PCR引物,其特征在于,上游引物和下游引物核苷酸序列分别如SEQ ID No.3和SEQ ID No.2所示。
5.一种用于检测GII型诺如病毒的引物组合,其特征在于,包括权利要求3或4所述的RT-PCR引物和权利要求1或2所述的巢式PCR引物。
6.一种检测GII型诺如病毒的试剂盒,其特征在于,含有权利要求1或2所述的巢式引物、权利要求3或4所述的RT-PCR引物或者权利要求5所述的引物组合。
7.权利要求1或2所述的巢式引物、权利要求3或4所述的RT-PCR引物、权利要求5所述的引物组合或者权利要求6所述的试剂盒在检测牡蛎中GII型诺如病毒方面的应用。
8.一种巢式PCR扩增方法,其特征在于,步骤包括:
(1)第一轮RT-PCR扩增:以牡蛎样品中提取的总RNA为模板,采用权利要求1或2所述的RT-PCR引物进行扩增;
(2)第二轮巢式PCR扩增,以步骤(1)扩增产物为模板,采用权利要求3或4所述的巢式PCR引物进行扩增。
9.根据权利要求8所述的巢式PCR扩增方法,其特征在于,第一轮RT-PCR扩增的条件为:48-52℃反转录25-35min,93-95℃预变性1.5-3min;93-95℃变性25-35s,54-56℃退火25-35s,71-73℃延伸25-30s,30-40个循环;
第二轮巢式PCR扩增的条件为:93-95℃预变性4.5-6min;93-95℃变性25-35s,54-56℃退火25-35s,71-73℃延伸25-30s,30-40个循环。
10.一种检测牡蛎中的GII型诺如病毒的方法,其特征在于,将权利要求8或9所述的巢式PCR扩增方法获得的产物进行电泳,有300-400bp条带的为阳性结果;或者将巢式PCR扩增方法获得的产物进行测序,或者将巢式PCR扩增方法获得的产物电泳后取目标条带进行测序。
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