[发明专利]一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法有效
| 申请号: | 202110718614.3 | 申请日: | 2021-06-28 |
| 公开(公告)号: | CN113588810B | 公开(公告)日: | 2022-09-23 |
| 发明(设计)人: | 任洪强;林原;许柯;王黎晔 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
| 主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/06;G01N30/72;G01N27/623;G01N33/68 |
| 代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 刘红阳 |
| 地址: | 210023 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 环境 基质 微生物 蛋白质 样品 制备 方法 | ||
1.一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)基质样品前处理:器材预钝化处理步骤,将制备蛋白质组样品所用的器材置于预钝化处理水溶液中,浸泡6 -12小时,所述预钝化处理水溶液,化学成分以物质量浓度计包括:吐温-20:0.02-0.10 mol/L,月桂基硫酸铵:0.10-0.50 mol/L,十二烷基磺酸钠:0.05-0.20mol/L,脱氧胆酸:10-30 m mol/L;将基质样品在液氮中猝灭后,在液氮环境中加入研磨助剂研磨,得到粉末状基质样品,向所述粉末状基质样品中加入裂解液和提取液,并经过离心后,得到下层为有机相、上层为水相的分层混合液;(2)蛋白质提取和纯化:分别吸出所述步骤(1)中所述有机相和所述水相,并在所述有机相和所述水相中分别加入蛋白沉淀剂,所述蛋白沉淀剂用以将所述有机相和所述水相中的蛋白质沉淀,沉淀后的有机相和水相经过离心后,分离出沉淀A和沉淀B;混合沉淀A和沉淀B得到沉淀C;在向所述有机相和所述水相中分别加入所述蛋白沉淀剂前,还包括有机相纯化过程,向所述有机相中加入等体积质谱级超纯水,经过慢速涡旋振荡和离心后,得到纯化后的有机相;(3)蛋白水解:向所述步骤(2)中的所述沉淀C中加入蛋白溶解液进行蛋白溶解,经离心后,弃去沉淀,保留上清液,所述上清液中加入蛋白酶解液,得到酶解后的肽段样品;(4)肽段样品纯化:所述步骤(3)中酶解后的肽段样品经过纯化和冻干后,得到蛋白样品。
2.根据权利要求1所述的一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法,其特征在于,所述步骤(2)中的所述蛋白沉淀剂为醋酸铵甲醇溶液。
3.根据权利要求1所述的一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法,其特征在于,所述步骤(1)中,其中所述研磨助剂的加入质量为所述基质样品质量的10%-30%,所述研磨助剂为聚乙烯基聚吡咯烷酮粉末。
4.根据权利要求1所述的一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述裂解液为pH=6.5-8.5的50-200 m mol/L Tris和0.05-0.20mol/L SDS溶液;所述提取液为pH=7.0-9.0的Tris饱和苯酚。
5.根据权利要求1所述的一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述蛋白溶解液的各组分浓度为:三乙基碳酸氢铵为0.1-0.5 mol/L,二硫苏糖醇为8-12 mol/L和尿素为5-8 mol/L。
6.根据权利要求1所述的一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述蛋白酶解液包括蛋白酶解辅助液和蛋白酶解作用液。
7.根据权利要求6所述的一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法,其特征在于,所述蛋白酶解辅助液为蛋白酶水解促进剂DCA。
8.根据权利要求6所述的一种环境基质中微生物宏蛋白质组样品的制备方法,其特征在于,蛋白酶解作用液包括二硫苏糖醇、碘乙酰胺、碳酸氢铵和胰蛋白酶,向所述步骤(3)上清液中加入蛋白酶解作用液的次序是:二硫苏糖醇、碘乙酰胺、碳酸氢铵、胰蛋白酶,或者所述碳酸氢铵和所述胰蛋白酶同时加入。
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