[发明专利]一种与鸡冠高度相关的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与鸡冠高度相关的分子标记及其应用，属于生物基因技术领域。该分子标记核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，SEQ ID NO：1所示序列的SNP位点g.1061处有一个A/G的碱基突变，出现AA、AG和GG不同的基因分型。本发明还公开了检测该分子标记的引物对，包含该分子标记的试剂盒以及检测该分子标记的方法，利用该分子标记可对地方品种种鸡公鸡进行分型，以为其繁殖性状的育种以及分子辅助选育工作提供理论基础和参考数据。

技术领域

本发明涉及生物基因技术领域，特别是涉及一种与鸡冠高度相关的分子标记及其应用。

背景技术

在现代养禽业中，众多研究者与养殖者均意识到种公鸡对生产水平的高低有着重要的作用，特别是影响种蛋的受精率、孵化率，进而影响种鸡的经济效益。除合格的鸡舍环境、严格的饲养管理外，繁殖性状的选育也是获得种公鸡较高种用价值非常重要的因素。公鸡外貌的第二特征比如鸡冠、肉垂等受到雄性激素的调节，相互之间有着不同程度的相关性，可以间接反映公鸡雄性化发育的程度，可作为繁殖性状的选育指标。冠高是指用卡尺测量从鸡冠基部到最高冠齿的垂直距离，冠高是家禽第二性征的重要指标之一，与睾丸总质量密切相关。通过对冠高性状进行选育可对睾丸性状进行间接选择。

宁都黄鸡原名为“宁都三黄鸡”，系特优质型黄羽肉鸡，是江西省著名的优良地方肉用鸡种，宝贵的家禽品种资源，列入了1999年出版的《江西省畜禽品种志》。宁都黄鸡还具有个体矮小、肉质鲜嫩特点，并且所含蛋白质、总氨基酸及单位面积鸡纤维数量等指标均优于国内多个肉鸡品种，因此，具有较大的市场需求。而目前还没有通过鸡冠高度相关性状筛选宁都黄鸡的报道。

发明内容

本发明的目的是提供一种与鸡冠高度相关的分子标记及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，该分子标记可以通过与鸡冠高度的相关性对地方品种种鸡公鸡进行分型，以为其繁殖性状的育种以及分子辅助选育工作提供理论基础和参考数据。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供一种与鸡冠高度相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。

优选的是，SEQ ID NO：1所示序列的SNP位点g.1061处有一个A/G的碱基突变，出现AA、AG和GG不同的基因分型。

本发明还提供一种检测所述的与鸡冠高度相关的分子标记的引物对，包括：

上游引物F：5’-CGAGCACCCCCATCCATTT-3’；

下游引物R：5’-TTTCCTCACTCTTTCCCGGC-3’。

本发明还提供一种试剂盒，包括所述的引物对。

本发明还提供一种检测所述的与鸡冠高度相关的分子标记的方法，包括以下步骤：

步骤1：提取待检测鸡的基因组DNA；

步骤2：利用引物对进行PCR扩增，获取扩增产物；

步骤3：将步骤2所得的扩增产物经测序后，获取分子标记的基因型；

步骤4：根据基因型分析与鸡冠高度的相关性，且AG或GG基因型个体的鸡冠高度高于AA基因型个体的鸡冠高度。

优选的是，步骤2中，PCR扩增反应体系包括：DNA 1-2μL，2×PCR mix 7.5μL，上游引物和下游引物各1μL，H₂O补至15μL。

优选的是，步骤2中PCR扩增反应程序为：95℃3min；94℃15s，55℃15s，72℃ 30s，20cycles；72℃3min。

本发明还提供根据所述的分子标记、所述的引物对、或所述的试剂盒在检测鸡冠高度相关性状中的应用。