[发明专利]药物分子结构预测方法、装置、设备及存储介质有效

专利信息
申请号: 202110716346.1 申请日: 2021-06-25
公开(公告)号: CN113436689B 公开(公告)日: 2022-04-29
发明(设计)人: 洪振厚;王健宗;瞿晓阳 申请(专利权)人: 平安科技(深圳)有限公司
主分类号: G16C20/50 分类号: G16C20/50;G06F16/36;G06F16/35
代理公司: 深圳市精英专利事务所 44242 代理人: 李翔宇
地址: 518000 广东省深圳市福田区福*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 药物 分子结构 预测 方法 装置 设备 存储 介质
【权利要求书】:

1.一种药物分子结构预测方法,其特征在于,包括:

从预设的药物数据库中获取样本药物的分子结构信息,其中,所述分子结构信息包括所述样本药物的官能团;

根据所述样本药物的分子结构信息构建药物结构知识图谱,其中,所述药物结构知识图谱的节点为所述样本药物的官能团;

接收用户输入的药物设计要素,其中,所述药物设计要素包括功能官能团以及官能团的数量范围;

根据所述药物设计要素在所述药物结构知识图谱中获取节点序列,其中,所述节点序列包含所述功能官能团,所述节点序列包含的官能团的数量在所述官能团的数量范围内;

获取所述节点序列的节点向量,并将所述节点向量输入到预训练的文本分类模型中以得到所述节点序列的标签,所述标签用于指示所述节点序列对应的药物分子结构的稳定性;

若所述节点序列的标签为预设的目标标签,向用户输出所述节点序列对应的药物分子结构。

2.根据权利要求1所述的药物分子结构预测方法,其特征在于,所述根据所述样本药物的分子结构信息构建药物结构知识图谱,包括:

将所述样本药物的官能团作为所述药物结构知识图谱的节点添加到所述药物结构知识图谱的节点集合中;

逐一判断所述样本药物的任意两个官能团之间是否存在化学键;

若所述样本药物的两个官能团之间存在化学键,则在该两个官能团之间建立边,并将该两个官能团的边添加到所述药物结构知识图谱的边集合中。

3.根据权利要求2所述的药物分子结构预测方法,其特征在于,所述根据所述药物设计要素在所述药物结构知识图谱中获取节点序列,包括:

在所述药物结构知识图谱中,从所述功能官能团出发,沿着所述功能官能团与其它节点之间的边进行随机游走,得到节点序列;其中,随机游走的次数在所述官能团的数量范围内。

4.根据权利要求2所述的药物分子结构预测方法,其特征在于,所述根据所述药物设计要素在所述药物结构知识图谱中获取节点序列,包括:

在所述药物结构知识图谱中,从所述功能官能团出发,沿着所述功能官能团与其它节点之间的边进行游走,得到节点序列;其中,游走的次数在所述官能团的数量范围内,在游走过程中,返回到原来节点的概率为预设的返回概率参数,不返回到原来节点的概率为预设的离开概率参数。

5.根据权利要求3或4任一项所述的药物分子结构预测方法,其特征在于,所述获取所述节点序列的节点向量,包括:

对所述节点序列进行分词处理以得到分词集合;

对所述分词集合的词语进行词向量训练以得到所述分词集合的词语的词向量;

将所述分词集合的词语的词向量输入到预设的RNN模型中进行编码,以输出所述节点序列的节点向量。

6.根据权利要求1所述的药物分子结构预测方法,其特征在于,所述方法还包括:

若所述节点序列的标签不是预设的目标标签,返回所述根据所述药物设计要素在所述药物结构知识图谱中获取节点序列的步骤,直到所述节点序列的标签为预设的目标标签为止。

7.根据权利要求1所述的药物分子结构预测方法,其特征在于,所述根据所述样本药物的分子结构信息构建药物结构知识图谱之前,所述方法还包括:

对所述样本药物的分子结构信息进行数据清洗处理,以得到所述样本药物数据清洗后的分子结构信息。

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