[发明专利]G6PC及其所在基因组在制备肾透明细胞癌诊断或预后评估系统中的应用在审
申请号: | 202110711681.2 | 申请日: | 2021-06-25 |
公开(公告)号: | CN113430266A | 公开(公告)日: | 2021-09-24 |
发明(设计)人: | 徐文浩;张海梁;叶定伟;田熙;瞿元元;艾合太木江·安外尔;刘王睿;宿佳琦 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;G01N33/573;A61K45/00;A61P35/00;G16B20/50;G16B35/00;G16B50/00 |
代理公司: | 上海顺华专利代理有限责任公司 31203 | 代理人: | 蒋骏杰 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | g6pc 及其 所在 基因组 制备 透明 细胞 诊断 预后 评估 系统 中的 应用 | ||
1.检测G6PC表达量的试剂在制备透明细胞肾癌诊断或预后评估试剂或试剂盒中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:
其中,所述检测G6PC表达量的试剂为检测G6PC基因mRNA表达水平的试剂、检测G6PC基因编码的G6Pase蛋白葡萄糖6-磷酸酶的表达水平、或检测G6PC基因的启动子甲基化水平的试剂。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测G6PC基因mRNA表达水平的试剂包括对G6PC具有检测特异性的PCR引物,引物序列如SEQ ID NO:13~14所示。
4.一种透明细胞肾癌诊断或预后评估试剂盒,该试剂盒包含了检测G6PC基因mRNA表达水平的试剂、检测G6PC基因编码的G6Pase蛋白葡萄糖6-磷酸酶的表达水平、或/和检测G6PC基因的启动子甲基化水平的试剂。
5.促进或提高G6PC表达量的试剂在制备治疗透明细胞肾癌药物中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:
其中,促进或提高G6PC表达量的试剂为提高G6PC基因mRNA表达水平或提高G6PC基因编码的G6Pase蛋白葡萄糖6-磷酸酶的表达水平的试剂。
7.联合基因组在制备肾透明细胞癌预后评估试剂或试剂盒中的应用,其特征在于,该联合基因组为ADCY10、AMY2A、CA8、CEL、CYP26A1、CYP3A4、G6PC、HAO1、HK3、HMGCS2、ITPKA、NOS1、P4HA3、PFKFB1、PSAT1、RDH8、RRM2、TYR、UGT1A7以及UROC1的联合。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于:
其中,所述预后评估试剂为检测生物样品中所述联合基因组中各基因表达量的试剂,
所述预后评估试剂盒包含了检测生物样品中所述联合基因组中各基因表达量的的试剂。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于:
其中,所述的检测生物样品中联合基因组各基因表达量的试剂选自对各个基因具有检测特异性的PCR引物,该PCR引物的序列如SEQ ID NO.1~40所示。
10.一种肾透明细胞癌预后评估系统,其特征在于,包括权利要求8或9所述的预后评估试剂盒以及安装在终端载体上的亚群分类模型,
所述免疫亚群分类模型基于各基因表达量,根据如下公式进行样本分值计算,并根据分值确定当前样本的代谢分型,样本分值=
0.02108354×ADCY10+0.055415221×AMY2A+(-0.039834066)×CA8+0.030574711×CEL+0.073959631×CYP26A1+(-0.099395461)×CYP3A4+(-0.029400148)×G6PC+0.002392772×HAO1+0.08863801×HK3+(-0.00986571)×HMGCS2+0.073210921×ITPKA+(-0.045158291)×NOS1+0.041592301×P4HA3+0.108183411×PFKFB1+0.032215715×PSAT1+0.032054991×RDH8+0.018262536×RRM2+0.028898214×TYR+0.02533731×UGT1A7+0.142174067×UROC1。
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