[发明专利]一种用于迟缓爱德华氏菌检测的基因芯片探针组有效
申请号: | 202110709487.0 | 申请日: | 2021-06-25 |
公开(公告)号: | CN113249506B | 公开(公告)日: | 2022-11-08 |
发明(设计)人: | 侯进慧;李同祥;黄天姿 | 申请(专利权)人: | 徐州工程学院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6837;C12Q1/10;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 北京东方盛凡知识产权代理有限公司 11562 | 代理人: | 贾耀淇 |
地址: | 221018 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 迟缓 爱德华 检测 基因芯片 探针 | ||
1.一种用于迟缓爱德华氏菌检测的基因芯片探针组,其特征在于,包括捕获探针ET-CP、检测探针ET-DP、滚环探针ET-RCP,其中所述检测探针ET-DP是由ET-DPA,ET-DPB和ET-DPC按照5’-3’方向依次连接而成;
所述捕获探针ET-CP和所述检测探针ET-DP序列包括如下任意一组所示的序列:
(1)ET-CP1:5’-NH2-TTTTTTTGCGTCGATCTGATTAGCCA-3’;
ET-DP1:5’-CCTGCTGGGAGTTTCTGGATGTCAGAACACACGGGATACAGGA-3’,其中,ET-DP1A:CCTGCTGGGAGTTTCTG与迟缓爱德华氏菌基因组DNA互补;ET-DP1B:GATGTC;ET-DP1C:AGAACACACGGGATACAGGA,且与所述滚环探针ET-RCP的5’端和3’端序列互补,同时是所述滚环探针ET-RCP的引物和连接区域;
(2)ET-CP2:5’-NH2-TTTTTTTCCTTAATCACGTCGAG-3’;
ET-DP2:5’-CTCCCCTTTATCCAGC-ACTTAC-AGAACACACGGGATACAGGA-3’,其中,ET-DP2A:CTCCCCTTTATCCAGC与迟缓爱德华氏菌基因组DNA互补;ET-DP2B:ACTTAC;ET-DP2C:AGAACACACGGGATACAGGA,且与所述滚环探针ET-RCP的5’端和3’端序列互补,同时是所述滚环探针ET-RCP的引物和连接区域;
(3)ET-CP3:5’-NH2-TTTTTTTCATGGTCTTCTGGATCTGCA-3’;
ET-DP3:5’-GCTGCGCCTGGGTGACGA-GATGTC-AGAACACACGGGATACAGGA-3’;其中,ET-DP3A:GCTGCGCCTGGGTGACGA与迟缓爱德华氏菌基因组DNA互补;ET-DP3B:GATGTC;ET-DP3C:AGAACACACGGGATACAGGA,且与所述滚环探针ET-RCP的5’端和3’端序列互补,同时是所述滚环探针ET-RCP的引物和连接区域;
(4)ET-CP4:5’-NH2-GCGTCGATCTGATTAGCCA-3’;
ET-DP4:5’-CAGACGTTATAGGACTG-ACTTAC-AGAACACACGGGATACAGGA-3’;其中,ET-DP4A:CAGACGTTATAGGACTG与迟缓爱德华氏菌基因组DNA互补;ET-DP4B:ACTTAC;ET-DP4C:AGAACACACGGGATACAGGA,且与所述滚环探针ET-RCP的5’端和3’端序列互补,同时是所述滚环探针ET-RCP的引物和连接区域;
所述滚环探针ET-RCP:5’-CGTGTGTTCTATTCTACTGTATTCTGTATGTCTCCGTCTGCCTGTCACCTGTGTATCTTTGTCCCGTCAGTCCTGTATCC-3’,其中所述滚环探针ET-RCP 5’和3’序列与所述ET-DP1C、ET-DP2C、ET-DP3C和ET-DP4C序列互补;
所述ET-CP1、ET-CP2、ET-CP3、ET-CP4序列与迟缓爱德华氏菌基因组DNA互补;所述ET-DP1A、ET-DP2A、ET-DP3A、ET-DP4A序列与迟缓爱德华氏菌基因组DNA互补;ET-CP系列探针中的ET-CP1、ET-CP2、ET-CP3、ET-CP4序列,与ET-DP系列探针中的ET-DP1A、ET-DP2A、ET-DP3A、ET-DP4A序列在迟缓爱德华氏菌基因组DNA存在时,相应的在T4 DNA连接酶作用下连接。
2.根据权利要求1所述的基因芯片探针组,其特征在于,所述基因芯片探针组还包括阴性对照探针ET-NC和阳性对照探针ET-PC,ET-NC和ET-PC序列不含有与迟缓爱德华氏菌基因组DNA序列互补的序列。
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