[发明专利]一种研究DNA甲基化调控重编程过程的方法在审
申请号: | 202110651752.4 | 申请日: | 2021-06-11 |
公开(公告)号: | CN113278686A | 公开(公告)日: | 2021-08-20 |
发明(设计)人: | 李碧春;张晨;左其生;张亚妮;孙红艳 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;G01N33/68;G01N33/58;G01N21/64;G01N1/30;G01N21/84 |
代理公司: | 扬州苏中专利事务所(普通合伙) 32222 | 代理人: | 许必元 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 研究 dna 甲基化 调控 编程 过程 方法 | ||
1.一种研究DNA甲基化调控重编程过程的方法,其特征是,包括以下步骤:
步骤(1)、在山中因子Oct4、Sox2、Klf4及c-Myc诱导的基础上添加DNA甲基化酶抑制剂5’aza,按照山中伸弥提供的诱导方法对体细胞进行诱导,在不同诱导天数观察细胞形态;
步骤(2)、当观察到出现细胞克隆时收集细胞进行荧光定量检测、间接免疫荧光检测、碱性磷酸酶染色、染色体核型分析和edu增殖检测;
步骤(3)、确定5’aza的效果后,将四因子和5’aza分别进行组合处理体细胞进行诱导,按步骤(2)中方法检测ips克隆的形成,确定最有效的组合形式;
在此基础上,单独使用5’aza进行诱导,按步骤(2)中方法检测ips克隆形成,进一步确定DNA甲基化抑制剂的单独诱导作用;从而有效探明DNA甲基化在重编程过程中的作用。
2.根据权利要求1所述的一种研究DNA甲基化调控重编程过程的方法,其特征是,步骤(2)中,荧光定量检测的方法为:收集克隆样细胞,添加Trizol 裂解液,进行RNA提取,反转录为cDNA后,实时荧光定量PCR检测Oct4、Sox2、Klf4及c-Myc的表达,同时检测多能性基因的表达以及体细胞标记基因的表达;
间接免疫荧光检测方法为:去除细胞培养孔板中的培养基,添加4%的多聚甲醛对细胞固定30min,PBS清洗后,0.1%的Triton 透膜处理15min,离心清洗后,封闭2h,加入Oct4,Sox2,Klf4,c-Myc,全能性标记蛋白和体细胞标记抗体,孵育过夜,清洗后,加入二抗孵育2h,清洗后加入DAPI孵育10min,荧光倒置显微镜下观察标记蛋白的表达;
碱性磷酸酶染色方法为:吸去培养基,PBS清洗干净后加入ALP固定液,固定3 min,PBS清洗后,加入ALP孵育液,避光15-20 min,PBS清洗;加入核固红染色或甲基绿染色3-5min,PBS清洗后进行镜检,观察克隆细胞能否呈现碱性磷酸酶活性;
染色体核型分析方法为:将细胞克隆按5×106的细胞接种在100mm口径培养皿中,至对数期,加入0.2ml的10μmol/L秋水仙酰胺,培养4h后,弃去培养基,加入胰蛋白酶孵育3min,加入10%FBS的DMEM终止消化,离心后,加入40mmol/L KCl和25mmol/L枸橼酸钠的低渗液重悬,静置后,加入等体积新鲜配制的冰冷的1:3醋酸甲醇固定液,静置10min,立新10min后,醋酸甲醇溶液重悬;用巴氏吸管吸一滴细胞悬液,从3米处滴在用冰块透凉的载玻片中;烘干后进行吉姆萨染色,5min后冲掉染液,观察染色体核型;
edu增殖检测方法为:取对数生长的细胞克隆,每孔1×105细胞接种于96孔板中,持续培养;每孔加入50μM Edu培养基孵育2小时,弃培养基,PBS清洗2次,加入4%多聚甲醛室温孵育30min,弃固定液;加入甘氨酸孵育5min,清洗后加入0.5% TritonX-100的PBS孵育10min;清洗后加入1× Apollo®染色反应液,避光孵育10min,弃反应液,加入0.5% TritonX-10的PBS清洗2-3次,甲醇清洗1-2次,Hoechest 33342反应液孵育30min,PBS清洗后,进行观察。
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