[发明专利]一种用于复制性AAV的检测方法有效
| 申请号: | 202110604419.8 | 申请日: | 2021-05-31 |
| 公开(公告)号: | CN113308492B | 公开(公告)日: | 2023-03-21 |
| 发明(设计)人: | 陈邵宏;郝丹丹;史天永;和赛超;牛琳琳 | 申请(专利权)人: | 北京中因科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N7/00;C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京中和立达知识产权代理有限公司 11756 | 代理人: | 郑茹 |
| 地址: | 102206 北京市昌平区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 复制 aav 检测 方法 | ||
1.一种不依赖于辅助病毒的痕量rcAAV的细胞学检测方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤,
A.细胞的转染和感染:
第1轮感染使用pHelper质粒和pRC8质粒转染细胞,转染后感染待测重组AAV病毒,感染2-3天后收集培养基上清,将所述上清与培养基混合后加入第2轮待感染细胞;
第2-N轮感染使用pHelper质粒和pRC8质粒转染细胞,转染后感染混合有培养基的上一轮细胞培养基上清,感染2-3天后再次收集培养基上清,将所述上清与培养基混合后加入下一轮待感染细胞;
B.用DNase I处理待测步骤A最终获得的细胞培养基上清;
C.利用taqman qPCR技术检测感染的细胞培养基上清中的rcAAV;
其中,步骤C中taqman qPCR所用的引物和探针序列如下所示:
rcAAV primer SET:
ITR-P5-taqF AGTGGCCAACTCCATCACTA
ITR-P5-taqR CCTCTAATACAGGACCTCCCTAAC
ITR-P5-probe CGTAATTCACGTCACGACTCCACCC
BGH primer SET:
BGH-F CCAGCCATCTGTTGTTTGCC
BGH-R ACTCAGACAATGCGATGCAAT
BGH-Probe CCCGTGCCTTCCTTGACCCT
步骤C中taqman qPCR配置体系为:
。
2.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于,步骤A中所述N=2-5。
3.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于,步骤B包括如下步骤:
在EP管中配置2ⅹDNase I mix,加入无核酶水、2ⅹDNase IBuffer、100U/ml DNase I,吹吸混匀后依次加入待测样品,得到2倍稀释样品1,PCR仪上37℃放置30min;75℃放置15min,处理后样品涡旋混匀,瞬时离心,离心后取稀释样品1加入无核酶水,将其稀释为20倍稀释样品2,涡旋混匀,瞬时离心。
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