[发明专利]一种微生物源双链RNA的快速制备方法在审

专利信息
申请号: 202110583398.6 申请日: 2021-05-27
公开(公告)号: CN113151335A 公开(公告)日: 2021-07-23
发明(设计)人: 莫芹;唐雪明;吕贝贝;孙宇;吴潇;宋丽莉 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12N15/70 分类号: C12N15/70;C12N15/113;A01N57/16;A01P7/04
代理公司: 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 代理人: 张晓敏;费开逵
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 微生物 源双链 rna 快速 制备 方法
【说明书】:

一种微生物源双链RNA的快速制备方法,通过将靶标基因插入含有T7启动子的表达型载体,将含靶标基因的表达载体转化至RNase III缺陷型大肠杆菌HT115(DE3),获得表达菌株;将表达菌株加入含有氨苄青霉素和四环素的TB液体培养基中,摇床过夜培养,再转接菌液至TB培养基,摇床培养后加入IPTG诱导剂,诱导17‑22h后结束发酵;将重组菌细胞悬浮于高盐浓度的TE缓冲液中,破碎细胞经过60‑80℃加热40‑60min后,离心获得dsRNA生物制剂。本发明提高了dsRNA的合成效率,降低生产成本,dsRNA的最终产量能达到17.90±4.20μg/mL。

技术领域

本发明属于农业病虫害防治领域,具体涉及一种微生物源双链RNA的快速制备方法。

背景技术

随着全球化的进行和环境变化,加剧了病虫害的分布和扩散,严重威胁人类的粮食安全问题,也迫使人们去开发新型可持续的病虫害防治策略。

RNA干扰技术(RNA interference,RNAi)是一项颇具潜力的绿色防控策略,可以选择任一基因作为靶标,能专一性地抑制靶标基因的实质表达,在线虫、节肢动物、植物病毒、真菌和其他病原菌等病虫害的防治方面均有大量研究报道。

RNAi途径是所有真核生物中控制基因表达水平的一种转录后调控方式,外源和内源的双链RNA(dsRNA)都可以诱导RNAi,从而特异性降解靶标mRNA分子。利用这一机制,可以开发出一整套可利用的害物防治方法,其中包括传统的转化形式即转基因植物,以及将dsRNA加工成不同制剂的形式。相比于转基因形式,后者相对开发成本低,不受转基因监管的限制,具有很好的产品开发应用前景。

目前RNAi在农作物保护方面的研究还面临诸多挑战,其中至关重要的一个便是如何廉价地制备大量的dsRNA以解决农业应用中的成本问题。目前,dsRNA的大量合成方法主要有体外酶法和微生物发酵法。

体外酶法主要利用T7噬菌体的DNA依赖型RNA聚合酶(DdRP)对特定的DNA模板进行转录并进行单链RNA退火杂交后获得dsRNA,该方法通常需要获得价格昂贵的T7 RNA聚合酶。

微生物发酵法是目前降低dsRNA成本最可行的方法,大量RNAi实验证实,可以利用RNase II缺陷型和DE3溶源的大肠杆菌合成dsRNA,但对其合成效率和产量研究较少。

目前,微生物源dsRNA用于生物农药的制剂一般直接采用菌体或者细胞破碎液,没有除杂和保护剂添加等措施,这不利于dsRNA生物制剂的生物防护效果和保存,而实验用的较纯的dsRNA制剂则需要将破碎后的细胞经过酚氯仿抽提、DNase和RNase I酶解、色谱柱纯化等处理,步骤复杂,产量低。目前报道的微生物工程菌中dsRNA最高产量为6.2μg/mL。

发明内容

本发明的目的在于提供一种微生物源双链RNA的快速制备方法,构建具有高表达量的表达菌株,优化大肠杆菌HT115(DE3)工程菌表达dsRNA的发酵条件,改进了工程菌发酵结束后dsRNA的分离提取和制剂方法,提高dsRNA的合成效率并进行快速提取,降低生产成本,为其在农业病虫害防治上的大规模应用提供保障。

为了达到上述目的,本发明提供如下技术方案:

一种微生物源双链RNA的快速制备方法,包括:

1)构建表达菌株

将靶标基因插入含有T7启动子的表达型载体,将含靶标基因的表达载体转化至RNase III缺陷型大肠杆菌HT115(DE3),获得高表达dsRNA的表达菌株;

2)发酵培养

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