[发明专利]与苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1紧密连锁的InDel分子标记与应用

说明书

本发明公开了一种苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1紧密连锁的InDel分子标记，该分子标记为InDel0362，它具有序列表中SEQ.ID.NO.1的碱基序列。苦瓜白粉病抗性主效QTLPm3.1与InDel分子标记均定位于苦瓜的3号染色体上，苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1，遗传距离14cM，物理距离为2.9Mb。据此，还开发了用于扩增该InDel分子标记的引物对及其试剂盒。利用该InDel分子标记可以实现苦瓜种质白粉病抗性的简便、快速、高通量检测，对加快白粉病抗性关键基因的挖掘利用，实现苦瓜抗白粉病分子育种有促进作用。研究表明，该分子标记的鉴定结果和田间接种鉴定结果一致，可在苗期白粉病未发病前对苦瓜育种材料进行分子标记辅助选择。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，尤其涉及一种与苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1紧密连锁的InDel分子标记与应用。

背景技术

苦瓜(Momordica charantia L.)为葫芦科苦瓜属一年生攀缘草本植物，具较高的营养价值和食疗功效。近年来，苦瓜种植面积不断增加，已成为“南菜北运”的主要蔬菜品种和特色产业。白粉病是瓜类蔬菜广泛发生的一种世界性病害，从苗期至收获期均可发生。近年来，随着瓜类蔬菜种植面积的增加和规模化发展，白粉病已成为导致减产和果实品质下降，阻碍绿色生产的主要病害之一。如在广西苦瓜种植基地五塘镇，年栽培面积近2万亩，年产量超过4500万公斤，而白粉病的发病率高达90％以上，因白粉病导致的产量损失近1000万公斤，经济收益损失达1500万元，导致严重的经济损失。

白粉病在苦瓜田间生长的各个时期均可发生，在苗期发病可造成苦瓜生长势减弱，发育迟缓；在开花期发病可导致苦瓜减产20-40％；在结瓜期发病，会导致植株叶片枯黄，果实生长缓慢，植株早衰，严重影响果实的品质和产量。农户在防治白粉病的过程中耗费了大量的劳动力和农资，过度使用的农药对产品质量及环境都造成极大的损害，因此，培育出抗病品种是防御白粉病的一条最安全、经济、有效的途径。

由于白粉病菌只能采用活体保存，发病程度容易受环境影响等特点，给抗病性鉴定带来极大不便，传统抗病育种周期长，需要大量及多代配置杂交组合及接种白粉病观察，严重阻碍了瓜类蔬菜抗白粉病品种选育进程。

随着分子生物学技术的飞速发展，分子育种技术大大加快了抗病育种的进程，显著缩短了抗病品种选育的周期。DNA分子标记技术因其具有多态性高、检测方便、快速、准确等特点，在农作物抗病遗传育种中发挥了极其重要的作用。

InDel(Insertion-deletion，插入缺失序列)分子标记是指同一物种个体之间或是近缘物种发生碱基序列缺失或插入。在基因组中InDel的密度仅次于SNPs，其数目多且分布广泛。由于InDel分子标记本身的丰富性，随着高通量测序的发展使其适用于全基因组，具有以下优点：其多态性分布在种间和种内，具有通用性；其检测方法便捷且技术要求低等，现在普遍被应用于分子辅助遗传育种、群体遗传分析和遗传图谱构建等方面。在InDel分子标记技术通常基于聚合酶链式反应(PCR)扩增技术，本质上属于长度多态性标记。InDel分子标记技术具有共显性、操作简便和稳定性好等特点，是一种较理想的分子标记技术。

然而，目前有关苦瓜白粉病主效QTL精细定位及其相关分子标记的研究尚不完善

发明内容

本发明要解决的技术问题是提供一种苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1紧密连锁的InDel分子标记与应用。

为解决上述技术问题，本发明采用以下技术方案：

一种苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1紧密连锁的InDel分子标记，该分子标记为InDel0362，它具有序列表中SEQ.ID.NO.1的碱基序列。

该分子标记由引物InDel0362 F和InDel0362 R扩增而得，引物InDel0362 F和InDel0362 R分别具有序列表中SEQ.ID.NO.2和SEQ.ID.NO.3的碱基序列。